华大智造DNB-seq靠谱吗？

DNB-seq是什么？

DNB-seq，即DNA纳米球测序，是华大智造测序平台采用的测序方式。2015年至2018年，华大智造相继推出了拥有完全自主知识产权、具有国际先进水平的桌面型测序仪BGISEQ-500、BGISEQ-50、MGISEQ-2000、MGISEQ-200以及DNBSEQ-T7，其中作为全球首款日通量最高的基因测序仪，DNBSEQ-T7日产出高质量数据1-6 Tb，广泛适用于全基因组测序、超深度外显子组测序、表观基因组测序、转录组测序和肿瘤Panel等测序项目。

相较于Illumina测序，华大DNB-seq与其有着巨大的特异性和优势。首先，文库制备环节，华大测序平台文库为单链环化文库，该文库是为了进行后续的DNA纳米球的生成。在放大信号的环节，Illumina采用桥式PCR的手段放大碱基信号，而华大平台则是利用构建好的单链环化文库进行滚环扩增，生成一个一个的DNA纳米球。随后，DNA纳米球加载至流动槽，通过阵列式芯片，保证采集信号时干扰降低，随后利用cPAS（联合探针锚定聚合技术）进行信号的采集，后续利用软件对信号进行识别（详细点击：华大基因DNBSEQTM测序平台技术原理：https://www.bilibili.com/video/av90170287/）。

相较于Illumina测序，DNB-seq具有以下优势：1、DNB通过增加待测DNA的拷贝数而增强了信号强度，从而提高测序准确度；2、不同于PCR指数扩增，滚环扩增技术的扩增错误不会累积；3、DNB与芯片上活化位点的大小相同，每个位点只固定一个DNB，保证信号点之间不产生相互干扰；4、阵列化测序芯片和DNB测序技术的结合，使得成像系统像素和测序芯片的面积得到最大化利用。其更高的准确率、更低的分子标签跳跃具有显著优势。

DNB-seq认可度高吗？

随着华大智造测序的逐步发展，现在华大智造测序结果已经受到了广泛的认可。以文章为例，仅2022年以来，利用DNB-seq进行的基因组测序和转录组重测序已经达到上百篇。

DNB-seq与转录组测序

DNB-seq与基因组测序

其中2021年 Giga Science和Genes & Genomics 分别发文Comparative analysis of 7 short-read sequencing platforms using the Korean Reference Genome: MGI and Illumina sequencing benchmark for whole-genome sequencing和Comparison between MGI and Illumina sequencing platforms for whole genome sequencing，探究了华大MGI测序平台和Illumina测序平台的数据情况，结果皆显示华大MGI平台数据各项性能与Illumina测序平台相当且具成本优势。

 在表观测序领域，DNB-seq也是广泛应用于ChIP、WGBS、HiC、miRNA等文库构建和测序。

而在当前大热的单细胞测序领域，通过文库的转换也是完全可以应用于DNB-seq测序平台。2021年至今，已有近百篇10X单细胞平台转化后进行DNB测序。

爱基的DNB-seq数据怎么样？

爱基百客针对前期项目DNA构建华大文库并进行T7平台测序与前期反馈的Illumina测序结果进行了比对，结果具有较好一致性。

写在最后：

5月6日，美国特拉华州联邦陪审团认定，Illumina完全侵犯了华大子公司Complete Genomics Inc.（CGI）的两项DNA测序专利，应该赔偿3.34亿美元给CGI，约合人民币22亿元。

测序领域虽然国产起步较晚，但是我们也不必妄自菲薄。测序，不仅仅是Illumina。

持续关注我们，后续有惊喜…….比如，测序不要钱了？？？？