组蛋白修饰影响基因的表达

     众所众知，组蛋白修饰影响基因的表达。一些研究已经显示，在非生物胁迫下在植物基因的表达主要是由组蛋白修饰所调控的。但是在全基因组范围内探究胁迫相关的组蛋白修饰缺较少，农作物中的研究更是很少。在本次研究中，作者利用ChIP-seq和RNA-seq技术探究了在干旱胁迫下水稻全基因组内H3K4me3的分布模式，并且研究了该模式相关的基因表达模式。在正条件和干旱条件下，H3K4me3修饰分别关联到了51.1%和48%的基因，RNA-seq结果显示分别有76.7% 和79%的基因发生了表达。作者以一个量化的标准鉴定不同基因的H3K4me3水平，发现4837个基因H3K4me3水平发生了改变，其中3927个基因H3K4me3水平增加，910个基因H3K4me3水平降低。在干旱胁迫下，5866个基因的表达发生差异，其中2145个基因上调表达3721个基因下调表达。将H3K4me3差异水平与基因表达水平相关联分析，H3K4me3水平的差异仅仅影响了一小部分基因的表达差异。在这类基因中，一部分基因的H3K4me3水平差异与基因表达差异显著正相关。除此之外，两者呈负相关关系。总的来说，H3K4me3和基因表达水平的综合分析为以后研究表观遗传调控植物对非生物逆境的响应有着重要的意义。