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武汉爱基百客生物科技有限公司(简称爱基百客),注册于2014年12月31日,次年10月正式开始对外运营,是一家专业提供表观组学技术服务、高通量测序、单细胞测序分析的新型生物科技服务企业。

公司总员工已达到百余人,其中95%以上具有学士学位,40%以上具有硕士及以上学位,专职科研人员20余人,专职销售人员30余人,覆盖全国90%的省市,核心成员来自国内知名高效、基因测序公司、信息分析公司等。

公司运营至今销售额累积1亿左右,成为国内成长最迅速的二代测序与生物科研服务企业之一。




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ChIP Spike-in 了解下

染色质免疫共沉淀(ChIP-seq)实验被广泛用于确定整个基因组中任何感兴趣的蛋白质的结合位置,包括转录因子、RNA聚合酶以及有或没有各种修饰的组蛋白。实验时,通常情况下是研究一种细胞类型和一种特定条件下蛋白质的结合位置,但是原则上来说,并没有限制几种细胞类型组织或者实验条件。当然,实验时,如果真的需要比较不同细胞类型、组织和条件下蛋白质的结合情况,需要将结果进行标准化。常规的标准化方法是使用分位数归一化方法,这种方法在探究蛋白质在全基因组中的结合位点时使用良好,但是一旦进行差异比较时,显得劣势。这时候,sample-to-sample标准化步骤就显得格外的重要。由此隆重推出本次的 ChIP Spike-in。

什么是ChIP spike-in?

ChIP Spike-in的是一个ChIP实验中,加入已知外源的染色质和已知的外源抗体用于整个实验质控及标准化Z常用就是加入果蝇的染色质抗体



为什么要做ChIP Spike-in呢?

使用spike-in内参可以减少假阳性的结果。具体方法是在每个处理样本中加入相同比例的参照样本。加spike-in重复间的相关性明显增强。具体的见下方图示:

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图:在ChIP实验中,添加spike-in和不添加spike-in时结果的差别


ChIP spike-in的技术优势有哪些呢?

ChIP Spike-in 优势

1、 减少技术误差效应

2、 检测标准ChIP分析无法观察到的细微生物学差异

3、 是否可以无偏差应用于不同的抗体和样本


ChIP spike-in的实验流程?

给大家展示一个示意图,就能够一目了然了。

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图:ChIP spike-in流程示意图,human为spike-in样本


好了,今天ChIP spike-in就聊到这里了,不要问我们做不做ChIP spike-in,问不问我们都做的对于一个ChIP技术熟练到家的资深ChIP户,只要与ChIP技术相关,有啥不阔以的捏。


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