文献分享 | 染色质可及性分析表明 TFAP2A 促进肺癌细胞对安罗替尼的获得性耐药中的血管生成

题目：Chromatin accessibility analysis reveals that TFAP2A promotes angiogenesis in acquired resistance to anlotinib in lung cancer cells

期刊：Acta Pharmacologica Sinica

研究方向：非小细胞肺癌（NSCLC）细胞在耐药中的血管生成

主要研究材料：NCI-H1975 和耐安罗替尼 NCI-H1975 细胞

研究思路：

主要研究内容：

1、NCI-H1975 和耐安罗替尼 NCI-H1975 细胞的转录组分析，RNA-seq显示AR细胞中血管生成相关基因表达上调。

2、NCI-H1975 和耐安罗替尼 NCI-H1975 细胞的染色质开放性分析，转录因子分析，以及和转录组联合分析，发现TFAP2A可能与安罗替尼耐药有关，并进行了TCGA 队列NSCLC 患者的生存分析。

3、为了揭示TFAP2A在安罗替尼耐药中的潜在作用，作者构建了TFAP2A敲低细胞系，通过伤口愈合试验、管形成测定评估了TFAP2A的促血管生成作用。

4、随后作者对AR细胞系和TFAP2A敲低细胞系进行了RNA-seq，结合ATAC-seq的开放性区域鉴定了TFAP2A的靶标基因，并进行了ChIP-qPCR的验证。

文章总结：

作者通过ATAC-seq+RNA-seq以及验证实验发现了TF TFAP2A能够通过调节BMP4的表达在安罗替尼耐药中起重要作用。