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肿瘤明星转录因子研究策略和汇总转录因子是具有DNA结合域的蛋白质，它与启动子和/或增强子区域的特定DNA序列结合，并与其他辅助因子和RNA聚合酶II相互作用，调控靶基因的转录。
基因调控及其关键元件。转录因子（TFs）与启动子区域和顺式调节元件（CREs）结合，取代核小体，使转录起始位点可接近。TFs、辅助因子和其他蛋白质之间的合作允许RNA聚合酶蛋白复合物的招募和稳定，DNA合成mRNA[1]。 往期，我们分享了不少关于转录因子的推文，从介绍，研究方法到研究思路。 转录因子研究策略大体分为四个方面，从筛选，到验证，功能分析，再到下游的机制研究。与之对应的技术手段如下。
往期，我们聊到频率比较高的是研究技术和思路，今天我们重点关注下肿瘤相关的转录因子。 肿瘤研究是国内外科学界的一个重要热点领域，国家自然科学基金每年资助的肿瘤相关项目也相对较多。转录因子被认为是极具潜力的治疗靶点的一个主要原因是转录失调在多种疾病中发挥着重要作用，而肿瘤研究中有一些研究频率较高的明星转录因子。
部分明星转录因子国自然基金资助情况(数据来自赛特新思) 癌症被定义为细胞的不受控制的增殖，主要是由于原癌基因和/或肿瘤抑制基因的调控失调。因此，原癌基因可能因突变、染色体易位、基因扩增和表观遗传变化而成为激活的“功能获得”癌基因。类似地，负责细胞周期负调控的肿瘤抑制基因，可能由于“功能丧失”突变或其中一个等位基因的缺失而失活。 癌基因可以被分类为细胞内信号转导因子、细胞周期调节因子、生长因子或生长因子受体、凋亡抑制因子以及转录因子（TFs）。据估计，约有20%的致癌基因被鉴定为TFs，而其中有一些明星转录因子是研究的较多的。如p53、Myc、雄激素受体 (AR)、雌激素受体 (ER) 、缺氧诱导因子 (HIF)、NF-κB等转录因子，它们参与各种促癌事件[2]。p53是研究最多的肿瘤抑制因子，在超过50%的人类癌症中发生功能获得性突变失活或变成致癌物。核受体AR和ER分别与内分泌驱动的前列腺癌和女性癌症（如乳腺癌、卵巢癌和子宫内膜癌）的发病机制密切相关。HIF-1在大多数实体瘤中过度表达。NF-κB是经典激活巨噬细胞的关键转录因子，可介导产生大量炎症因子。 我们汇总研究频率较高的癌症转录因子。
除了表上统计的，其实还有很多其他的明星转录因子。比如说FOX家族蛋白，它是一个转录因子大家族，它共享一个高度保守的100个氨基酸的DNA结合结构域（DBD），称为叉头结构域。这些转录因子参与调控许多生物过程中关键基因的表达，包括发育、代谢、分化和免疫反应。 Fox转录因子家族被分为若干亚家族，每个亚家族以一个字母标识（例如，FoxA、FoxB、FoxC等）。它是现今肿瘤学、医学细胞生物学、遗传学、免疫学等领域的研究热点。其多个家族成员可作为肿瘤靶向治疗直接或间接的作用靶点，在一些肿瘤类型中，也可作为肿瘤早期诊断或预后监测。在肿瘤研究中，FOX（Forkhead Box）转录因子家族涉及多个成员，除了FOXO类和FOXK类蛋白，还有其他一些FOX转录因子（FOXM1、FOXP3、FOXA 类 (FOXA1, FOXA2, FOXA3)等）也受到研究者的关注。 类似地，STAT蛋白家族也是一组重要的转录因子，在细胞信号传导和基因调控过程中发挥关键作用。STAT蛋白通过JAK-STAT信号通路被细胞因子和生长因子激活。激活后的STAT蛋白可转移到细胞核，调控与细胞生长、分化、凋亡以及免疫反应相关的基因表达。STAT蛋白家族由七个主要成员组成：STAT1、STAT2、STAT3、STAT4、STAT5A、STAT5B和STAT6。 它们在协调癌细胞、免疫细胞和肿瘤微环境中的脂肪细胞高度动态代谢中所发挥的核心作用，尤其是STAT3、STAT5、STAT6和STAT1。鉴于STAT蛋白在代谢状态调节中的核心作用，它们是改变癌症代谢重编程的潜在治疗靶点[3]。 · 转录因子BATF增加CAR-T细胞抗肿瘤活性 · Depletion of BATF in CAR-T cells enhances antitumor activity by inducing resistance against exhaustion and formation of central memory cells.
· 转录因子YB-1正调控KLF5，促进基底样乳腺癌的进程 · YB-1 is a positive regulator of KLF5 transcription factor in basal-like breast cancer.
YB-1和KLF5促进BLBC进展的机制 武汉爱基百客生物科技有限公司是一家专业提供表观组学技术服务、高通量测序和单细胞测序分析的新型生物科技服务企业。公司主营业务ChIP-seq、CUT&Tag、ATAC-seq和RNA-seq等技术已助力国内多个课题组发表有关肿瘤或其他疾病转录因子的高水平文章，王牌产品ChIP-seq拥有100+疾病相关转录因子经验。
部分疾病转录因子文章
疾病相关转录因子抗体经验
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【1】Badia-i-Mompel P, Wessels L, Müller-Dott S, et al. Gene regulatory network inference in the era of single-cell multi-omics[J]. Nature Reviews Genetics, 2023, 24(11): 739-754. 【2】 Vishnoi K, Viswakarma N, Rana A, et al. Transcription factors in cancer development and therapy[J]. Cancers, 2020, 12(8): 2296. 【3】Li Y J, Zhang C, Martincuks A, et al. STAT proteins in cancer: orchestration of metabolism[J]. Nature reviews Cancer, 2023, 23(3): 115-134. 了 解 更 多 { 往 期 精 彩 回 顾 } 精选合集，欢迎收藏哟！
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