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武汉爱基百客生物科技有限公司(简称爱基百客),位于武汉高农生物园,办公面积逾3000平方米,是一家专业提供单细胞与空间组学测序分析、表观组学科研服务和高通量测序分析的新型生物科技服务企业。

公司旨在为客户提供最专业的科研服务,运营至今合作的科研客户近千家,涵盖国内知名科研院所、高校以及相关生物企业,运营至今销售额超1亿元,科研成果曾多次在Science、Cancer Cell、Plant Cell、Nature Communications、J HEMATOL ONCOL等国际高水平学术期刊发表,受到了客户广泛好评,是国内成长最迅速的高通量测序科研服务企业之一。

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Tn5转座酶:基因组学研究的革命性工具

在生命科学研究领域,有一种被称为"分子剪刀手"的酶正在改变着基因组学的研究方式——它就是Tn5转座酶。从最初被发现时的"跳跃基因"现象,到如今成为实验室不可或缺的"瑞士军刀",Tn5转座酶的发展历程堪称分子生物学工具改造的典范。

从"跳跃基因"到分子工具

1940年代,遗传学家Barbara McClintock在研究玉米时首次发现了"转座子"现象——某些DNA片段可以在基因组中"跳跃"。这一革命性发现让她获得了1983年诺贝尔生理学或医学奖。转座酶作为介导这一过程的关键酶类,主要分为两类:

  • DNA转座酶:采用"剪切-粘贴"机制,直接将DNA片段转移到新位点

  • 逆转座酶:通过RNA中间体实现"复制-粘贴"机制

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图1. 转座酶结构及功能

其中,源自大肠杆菌的Tn5转座酶因其独特的特性引起了科学家的特别关注。

工程改造:从自然现象到实用工具

科学家们对天然Tn5转座酶进行了精妙的工程改造:

  • 提高催化活性,开发出"超活性"变体
  • 使其能够携带人工设计的测序接头
  • 优化反应条件,提高稳定性和效率

这些改造使Tn5从一种自然现象转变为可控的分子工具。

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图2. Tn5作用于DNA序列

Tagmentation技术:一举两得的创新

Tn5转座酶最核心的创新在于其"Tagmentation"技术(片段化+标签化),这一技术将传统测序文库制备中繁琐的多步操作简化为一步完成:

  • 复合物组装:Tn5与测序接头预先结合

  • 靶向切割:在DNA随机位点进行双链切割

  • 同步标记:在切割的同时连接测序接头

这种创新不仅大大提高了效率,还将所需DNA量降低到纳克甚至皮克级别,为微量样本研究开辟了新途径。

四大核心应用场景

01
高通量测序文库制备

Tn5显著简化了全基因组测序(WGS)、靶向测序、扩增子测序等各种NGS文库的构建。相较于传统的超声破碎或酶切片段化后进行多步连接的方法,Tn5的一步法文库制备流程更快、更高效,尤其适用于处理微量或珍贵的DNA样本。

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图3. Tn5建库基本流程

02
染色质可及性分析(ATAC-seq)

ATAC-seq(Assay for Transposase-Accessible Chromatin with sequencing)是Tn5转座酶最具代表性的应用之一。在ATAC-seq中,Tn5转座酶被巧妙地利用:它能够优先插入到这些开放染色质区域(open chromatin regions),而难以插入被核小体或DNA结合蛋白紧密占据的区域。通过对Tn5插入位点进行测序,研究人员可以高分辨率地绘制出全基因组的染色质可及性图谱,从而识别出潜在的启动子、增强子、绝缘子等基因调控元件,深入理解基因表达调控机制。

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图4. ATAC-seq技术原理

03
单细胞表观基因组研究(scATAC-seq)

随着单细胞组学技术的兴起,Tn5转座酶在单细胞ATAC-seq (scATAC-seq) 中发挥了不可替代的核心作用。它能够在nL甚至pL级的微反应体系中,对单个细胞中极微量的DNA进行高效的片段化与接头连接。这使得研究人员能够在单细胞分辨率上,揭示细胞类型特异性的染色质可及性、追踪细胞发育轨迹、解析肿瘤微环境中的细胞异质性,并识别稀有细胞群体的独特表观基因组特征。

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图5. scATAC-seq技术原理

04
蛋白质-DNA互作研究(CUT&Tag)

CUT&Tag是一种高效的表观遗传学方法,用于研究蛋白质-DNA相互作用。该技术利用融合了蛋白A/G的Tn5转座酶(proteinA/G-Tn5),通过抗体将proteinA/G-Tn5招募到目标蛋白结合的染色质区域。一旦被招募,proteinA/G-Tn5在局部进行DNA双链切割,并将测序接头插入切割位点。这种靶向性的Tagmentation,使得CUT&Tag能够以极低的细胞输入量实现高分辨率高信噪比的表观基因组图谱绘制,成为了继ChIP-seq的另外一种蛋白质-DNA互作技术的选择,极大简化了实验流程并提高了效率。

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图6. CUT&Tag技术原理

未来展望

    随着单细胞技术和空间组学的发展,Tn5转座酶的应用前景更加广阔。在以下领域尤其值得期待:

    • 发育生物学中的细胞命运追踪
    • 疾病机制研究,特别是肿瘤异质性分析
    • 精准医学中的诊断标记开发
    • 合成生物学中的基因组工程

    从基础研究到临床应用,Tn5转座酶正在持续推动生命科学研究的边界扩展。这个小小的分子工具,或许还将为我们带来更多惊喜。如有相关技术咨询(ATAC-seq,CUT&Tag,单细胞ATAC-seq,单细胞CUT&Tag),欢迎联系我们~

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