多组Venn | 零代码绘制好看的花瓣图

 1  

爱基百客云平台小工具使用

首先，打开爱基百客官网：http://www.igenebook.com；点击菜单栏最右侧“云平台”按钮。

弹出云平台界面（下图），输入账号、密码和验证码方可登录；进入云平台，可以轻松实现多种组学数据的分析和可视化，实现真正的“零代码、无门槛、操作简单”！

登录后，如下图，我们进入到小工具专栏。当前云平台已上线了33款小工具供大家使用，包括基础绘图、高级绘图、差异检验、聚类分析和序列处理等子模块，本着用户至上的理念，平台小工具将会持续更新维护，积极接受用户的反馈和意见。

1.1 

爱基百客云平台小工具科研常用绘图之花瓣图

Venn图是一种用于展示两个或多个集合之间的关系的图形表示方法。它由英国逻辑学家和数学家约翰·维恩在1880年首次提出。不过，随着数据集的增加，Venn图的复杂度也会增加，如超过四集合Venn图对于人类视觉来说可能难以准确解释。花瓣图（Flower Plot）是一种韦恩图的一种变体或美化形式，通常用来展示多个集合（通常是 3~15 个）之间的重叠关系，但以“花瓣围绕中心”的形式展现，更具视觉美感与对称性。

花瓣图中每个“花瓣”代表一个集合（如一个实验组、一个样本、一个通路），中心区域是所有集合的交集，外围则是每个集合独特元素。

爱基百客云平台花瓣图可视化地址：http://182.61.3.169:5000/smalltools/detail?id=1676067607037362177。

下面我们进行花瓣图可视化实操练习。

首先点击小工具花瓣图

右侧的工具介绍对花瓣图小工具的主要用途，使用方法以及结果解读做了详细的说明。

左侧是必要的输入文件和参数选项。任务名称和任务编号系统会自动生成。后面可用于记录查看具体的任务。其中花瓣中心和花瓣的叶子均可定制自己喜欢的颜色。中心圆圈默认白色。注意叶子的配色数需与集合数一致，中间用下划线分隔。示例文件里有8个集合，故这里填写“#6181BD4E_#F348004E_#64A10E4E_#9300264E_#464E044E_#049a0b4E_#4E0C664E_#D000004E”。

小工具提供了示例文件给用户做测试分析。同时，该页面还提供了一些常用参数调节选项。您也可进行自定义，后面将详细介绍。输出名自定义。

1.2 

参数设置

输入文件：支持txt(制表符分隔)文本文件，以及Excel专用的xlsx格式，同样支持旧版Excel的xls(Excel 97-2003 )格式。

输入文件为各元素集合组成的表格。其中每一列代表一个集合，第一行表示集合的名称。如下表所示：

如果文件已经上传过，您可以直接点击选择按钮找到需要的文件勾选确定，无须再次上传。另外你可以根据自己的喜好选择不同的色系，输出名默认是result。

填写好上述所有的参数后，点击提交即可。

1.3 

任务查看

您可在任务管理栏中查看任务的运行情况和结果。默认情况下新任务将会在最上方展示。也可通过任务名、任务编码、日期点击查询，找到需要的任务。 如下图：当状态成功时，表示任务成功结束。

点击下载按钮可直接打包下载全部结果。点击查看按钮可在线查看结果。

您可在在线查看结果后选择是否下载保存。另外如果结果较多时，结果展示区还可通过点击左侧或右侧的箭头进行图片切换。您可挑选自己感兴趣的结果图片进行下载保存。

1.4 

结果

输出结果包含pdf格式和png格式的花瓣图以及交集元素表格。花瓣图中心展示所有集合的核心交集元素数。叶片展示了集合元素数。如何查看不同集合的交集情况。也提供了交集元素表格供具体查看。

1.4.1 花瓣图

也可根据自己的喜好换个配色试试。如使用’#8c510a”,“#bf812d”,“#dfc27d”,“#f2c396”,“#c7eae5”,“#80cdc1”,“#35978f”,“#01665e’ 这组经典渐变色系。

1.4.2 交集元素表格

交集元素表格如下表所示：

该表格总结了不同元素集合组合的计数和值信息。每行代表一种特定组合的状态。前面若干列代表的是输入的元素集合状态（TRUE 代表参与交集，FALSE代表的是不参与交集），倒数第二列是满足组合状态下的值，最后一列代表的是具体组合状态的交集元素。详细可参见【云平台教程 | 手把手教你科研实用绘图之Venn图】

项目咨询

了 解 更 多

精选合集，欢迎收藏哟！

• 项目文章

• ChIP专题

• DAP-seq专题

• ATAC-seq专题

• 单细胞测序专题

• CUT&Tag专题

• 甲基化专题

• RIP-seq专题

• 云平台教程

• 国自然热点