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手把手教你如何上传原始数据（GSA数据库）GSA组学原始数据归档库（Genome Sequence Archive）是组学原始数据提交、存储、管理与共享系统，是国内首个被国际期刊认可的组学数据发布平台。它是中国科学院北京基因组研究所国家基因组科学数据中心开发的一个服务于全球生命科学领域机构和实验室，用于存储基因组、转录组及其它组学原始序列的数据仓储。 相比以往大家熟知的NCBI，GSA数据库符合国家数据安全标准，而且可以选择中文界面，对国人来说使用感受更加友好。如果是人类遗传资源相关组学原始数据，遵从《中华人民共和国人类遗传资源管理条例》总则规定，建议您将数据提交到GSA-Human数据库，以实现人类遗传资源数据的受控访问、保障人类遗传源数据的安全性。
1. 首先需要先注册账户，建议使用实验室公共邮箱或PI邮箱进行注册。  2. 填写个人信息。    注：GSA for human数据上传需要身份审核。  3. 注册提交后，需要到填写的邮箱中激活（建议注册完立即认证，链接有效期24h）。  4. 激活登录后就可以开始准备提交原始数据了。  5. 首先需要创建BioProject。  6. 点击新建BioProject。  7. 检查个人信息，网站会自动帮您填入您注册时填写的信息。注意：若注册GSA邮箱与提交者信息邮箱不一致，当数据信息审核与文件归档过程中出现任何问题，信息将反馈到您的注册邮箱，而非此处填入的提交者信息邮箱。  8. 填写项目信息，带有“*”符号的均为必填项，其它均为非必需项。指定日期发布最多可以选到两年后。项目标题可以套用文章标题，项目说明可以简单讲述您做了哪些测序，如转录组+代谢组等。机构可以点击选择也可自行填写。项目批准号如果不知道可以填写“N/A”。   9. 根据自己的数据选择对应的数据类型。  10. 选择出版信息，此处如果是已发表文章需要补充数据可以将文章ID或DOI号码输入，如果是未发表文章直接点击下一项即可。  11. 核对一下点击提交。  12. 等待网站后台审核期间，继续进行下一步——创建BioSample。  13. 点击新建BioSample。  14. 检查个人信息。  15. 设置发布日期及提交类型。项目编号选择您刚刚创建的BioProject编号。  16. 选择对应样本类型。注：人类样本需提交到GSA for human数据库，此处以小鼠样本为例。  17. 提交样本批量信息。首先点击下载模版文件。下方有填写示例文件，可下载参考。  18. 填写样本表格。绿色是必填项，灰色为选填项，蓝色为有条件填写项。  19. 文件填写保存后，上传您的文件，点击校验。若文件审核不通过，请点击“删除”键，删除已上传的文件并按系统提示信息修改后，再重新上传批量表格文件，直至审核通过:
 20. 最后检查一下即可点击提交了。  21. 等待审核期间可以先上传原始数据到GSA  22. 点击新建GSA  23. 检查个人信息  24. 设置基本信息。  25. 填写并上传元数据信息。首先下载模版文件，下方有填写示例可下载参考。  26. 填写表格，注：填写文件名一定要与上传的测序文件名一致；MD5码为每个测序文件特有，也需一一对应。   27. 保存填写后上传文件，点击校验。  28. 上传原始测序文件，建议通过FTP软件（https://filezilla-project.org/download.php?type=client）上传。  29. 下载并打开FileZilla软件  30. 输入连接地址及账户。主机即为网站给予的“Address”，用户及密码即为您注册GSA账号时的邮箱及密码。输入完成后点击连接。  31. 显示“列出”/”的目录成功”即为连接成功  32. 远端服务器如图显示  33. 首先按要求在GSA目录下创建文件夹，文件名按照要求填写。  34. 创建完成后点击进入并在左侧本地文件夹中找到需要上传的测序文件。找到文件右键选择上传。  35. 接下来等待文件全部上传完成  36. 检查信息无误后点击提交。后续等待官方审核，官方数据审核后，会发邮件到GSA账号邮箱中，通知审核结果。审核通过后收到的数据编号可以提供给期刊；审核不通过，根据邮件中提出原因对应进行修改后，重新提交，然后等官方下一轮邮件审核通知即可。  37. 审核通过后会在此页面生成对应的GSA编号，投稿文章时将此编号放入文章即可。  看完图文解析，你学会了吗？直观跟着视频教程练习更高效～ 项目咨询 了 解 更 多 { 往 期 精 彩 回 顾 } |
