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武汉爱基百客生物科技有限公司(简称爱基百客),位于武汉高农生物园,办公面积逾3000平方米,是一家专注于表观组学、单细胞时空组学和高通量测序分析服务的新型生物科技企业。


公司旨在为客户提供专业的科研服务,运营至今合作的科研客户近千家,涵盖国内知名科研院所、高校以及相关生物企业,运营至今销售额超1亿元,科研成果曾多次在Science、Cancer Cell、Plant Cell、Nature Communications、J HEMATOL ONCOL等国际高水平学术期刊发表,受到了客户广泛好评,是国内成长最迅速的多组学科研服务企业之一。

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PCR家族科普:PCR、qPCR、RT-PCR、RT-qPCR:还在傻傻分不清?


在分子生物学实验室里,PCR这个词大家肯定都不陌生。不过,要是给它加上q、RT这些前缀,是不是就有点让人摸不着头脑了?别急,今天这篇文章,就用最通俗易懂的方式,帮你把这四位“PCR家族”的成员给搞清楚!

一、师爷:PCR(聚合酶链式反应)


想象一下,你手里有一根DNA双链(原始文件),但浓度太低了,仪器检测不到。怎么办呢?PCR就是在一个小小试管里,通过"变性-退火-延伸"三个步骤循环(通常25-35个循环),把目标DNA片段指数级扩增。30个循环后,1个DNA分子就变成了10亿个!

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PCR原理


  • 核心功能是:DNA扩增。将一段特定的DNA序列,在体外进行百万倍乃至数十亿倍的复制。

  • 工作原理:高温变性(把DNA双链打开)→低温退火(让引物结合到目标序列)→中温延伸(合成新链)。重复这个循环30-40次,1个变2个,2个变4个……指数级增长。

  • 关键特点:只能定性,或者半定量。传统的PCR在反应结束后,通过琼脂糖凝胶电泳来看结果。你只能看到一条明亮的条带,知道“有”或者“没有”目标基因,但无法精确知道最开始到底有多少。

二、升级版:qPCR(定量聚合酶链式反应)

qPCR,也叫实时荧光定量PCR。它是PCR的强力升级版。

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qPCR原理

  • 核心功能是:“DNA扩增+实时定量”。不仅能检测到目标基因是否存在,还能精确计算出它最初的含量有多少。

  • 工作原理在PCR反应体系中加入了荧光染料或荧光探针。每完成一次扩增循环,荧光信号就会增强一点。仪器实时监测荧光强度的变化,通过一个叫做“Ct值”的参数,来反向推算出样本中起始的DNA模板量。Ct值越小,代表起始模板越多。

  • 关键特点精确定量、高通量、闭管操作避免污染。

  • 主要应用基因表达分析(看某个基因在细胞里活跃程度)、病原体检测定量(比如判断病毒载量)、转基因检测等。

转型者:RT-PCR(逆转录聚合酶链式反应)

RT-PCR里的"RT"是Reverse Transcription(逆转录),可不是Real-Time哦!

生物体的遗传信息流向是:DNA→RNA→蛋白质。PCR和qPCR只能复制DNA,但很多情况下我们研究的是RNA,这时候就需要先用逆转录酶把RNA变成cDNA(互补DNA),再进行常规PCR。这其实包括两个反应RT反应+PCR反应

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RT-PCR原理

  • 核心功能是:“RNA检测(间接)”。以RNA为模板,合成出一条与之互补的DNA链,这条DNA叫做cDNA。

  • 工作原理使用一种叫做“逆转录酶”的特殊工具,将RNA模板逆转录成cDNA。

  • 关键特点它本身不是一个完整的PCR,它只是PCR的一个前置步骤。得到了cDNA之后,才能用普通的PCR或qPCR进行后续的扩增或定量。

  • 应用场景检测基因是否表达、RNA病毒检测(如早期新冠检测)。

四、终极合体:RT-qPCR(实时定量逆转录聚合酶链式反应)

RT-qPCR(逆转录实时荧光定量PCR),顾名思义,就是先进行RT(逆转录),再进行qPCR(实时荧光定量)。

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RT-qPCR的流程


  • 核心功能是:对RNA进行定量分析。

  • 工作流程RNA样本→(RT逆转录步骤)→cDNA→(qPCR步骤)→实时荧光定量分析。

  • 关键特点这是目前检测RNA最常用、最灵敏的技术之一。

  • 明星应用

1. 新冠病毒检测

新冠病毒的遗传物质是RNA。检测时,就是用RT-qPCR技术,先将病毒的RNA逆转录成cDNA,再进行qPCR扩增和定量。如果检测到荧光信号超过阈值,就判读为阳性。

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图.通过RT-qPCR检测新冠病毒

2. 基因表达研究

提取细胞的总RNA,通过RT-qPCR来比较不同基因的表达量高低。

希望经过这样一番梳理,大家再看到这几个术语时,心里能有清晰的图谱。下次再听到“核酸检测用的是RT-qPCR技术”时,你就可以自信地跟朋友解释这背后的原理啦!

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