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真核RNA-seq贴心价990元/样品,让刚需不纠结,高效

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真核RNA-seq贴心价990元/样品,让刚需不纠结,高效

发布日期:2018-05-14 作者: 点击:

武汉爱基百客生物科技有限公司位于武汉国家生物产业基地——光谷生物城,是一家专业提供表观组学技术服务与表观组学生物信息分析的新型生物科技服务企业。

让刚需不纠结,高效更高质;贴心价 990 元/样本。

活动时间:

2018 年 5 月 15 号~2018 年 7 月 15 号

 

•  此费用仅针对 有参RNA-seq,且是真核生物样本;

•  客户需要提供足够的样本,以便满足后续实验,具体见样本信息表;

•  本次活动解释权归爱基百客所有。

技术简介

•    基因转录水平的研究是功能基因组学和医学研究的基础。RNA-Seq是用来研究某一生物对象在特定生物过程中基因表达差异的技术。该技术结合了RNA-seq建库的实验方法与数字基因表达谱(Digital Gene Expression Tag Profiling, DGE)的信息分析手段,可广泛应用于生理调控、农业性状、环境改造、疾病机制和药物筛选等领域。

技术优势

1. 分析时效快:自主分析云平台,极大提升分析效率,实现结果5天交付;

2. 质量高标准:数据质量、均一性,样本相关性等指标均高于质控标准;;

3. 检测阈值宽:跨越6个数量级的宽检测阈值,从几个到数十万个拷贝精确计数;

4. 良好的重复性:深度测序保证了抽样随机性,重复性非常好;

5. 定量更准确:使用RPKM方法计算基因表达水平;

服务流程

基因表达调控

质控评估

针对RNA样本,采用电泳、NanoDrop、Q-Sep1等方法进行样品检测。构建完成的文库,采用Q-Sep1测浓度和片段长度,并用Qubit®检测文库分子浓度。文库片段大小,浓度必须符合上机标准。

分析内容

       1)对原始数据进行去除接头污染序列及低质量reads的处理

       2)测序评估(包括:数据比对统计、测序质量评估、测序饱和度分析、均一性分析、相关性分析

 Reads在 参考基因/基因组上的分布分析)

       3)基因表达注释(包括:基因覆盖度统计、结果文件列表、结果文件示例)

       4)差异表达基因分析

       5)组间差异表达基因分析

       6)差异基因表达模式聚类分析

       7)GO功能显著性富集分析

       8)GO功能分类分析(WEGO分析)

       9)KEGG pathway分析

采用平台

BGISEQ-500RS测序平台

采用联合探针锚定聚合技术(cPAS)和DNA纳米球(DNB)核心测序技术,带来准确的RNA定量结果,是极具高性价比的基因表达研究方案。

 

参考文献

[1].     Chen, K., Liu, J., Liu, S.,et al.(2017). Methyltransferase SETD2-Mediated Methylation of STAT1 Is Critical for Interferon Antiviral Activity. Cell, 170(3), 492-506 e414. doi: 10.1016/j.cell.2017.06.042

[2].     Fu, Y., Li, L., Hao, S.,et al. (2017). Draft genome sequence of the Tibetan medicinal herb Rhodiola crenulata. Gigascience, 6(6), 1-5. doi: 10.1093/gigascience/gix033

[3].     Shu, X. S., Zhao, Y., Sun, et al. (2018). The epigenetic modifier PBRM1 restricts the basal activity of the innate immune system by repressing retinoic acid-inducible gene-I-like receptor signalling and is a potential prognostic biomarker for colon cancer. J Pathol, 244(1), 36-48. doi: 10.1002/path.4986

[4].     Wang, N., Wang, Q., Tang, H., et al. (2017). Direct inhibition of ACTN4 by ellagic acid limits breast cancer metastasis via regulation of beta-catenin stabilization in cancer stem cells. J Exp Clin Cancer Res, 36(1), 172. doi: 10.1186/s13046-017-0635-9

[5].     Xin, B., Tao, F., Wang, Y., et al. (2017). Coordination of metabolic pathways: Enhanced carbon conservation in 1,3-propanediol production by coupling with optically pure lactate biosynthesis. Metab Eng, 41, 102-114. doi: 10.1016/j.ymben.2017.03.009

[6].     Yao, L., Wang, J., Li, B.,et al. (2018). Transcriptome sequencing and comparative analysis of differentially-expressed isoforms in the roots of Halogeton glomeratus under salt stress. Gene, 646, 159-168. doi: 10.1016/j.gene.2017.12.058

[7].     Zhang, B., Liu, H., Ding, X., et al. (2018). Arabidopsis thalianaACS8 plays a crucial role in the early biosynthesis of ethylene elicited by Cu(2+) ions. J Cell Sci, 131(2). doi: 10.1242/jcs.202424


本文网址:http://www.igenebook.com/news/365.html

关键词:基因表达调控,基因表达定量,表观组学技术服务

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