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“色彩斑斓”的10×Genomics单细胞平台

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“色彩斑斓”的10×Genomics单细胞平台

发布日期:2020-08-20 作者:程伟 点击:

10×Genomics单细胞仪器问世以来,各种单细胞相关文章如火如荼发表。疾病机制解析、分子marker鉴定、细胞分化时序分析等等问题迎刃而解,人们对肿瘤的认识更透彻。通过10×Genomics单细胞平台进行实验的物种和组织样本多种多样,下图是10×Genomics官网公布的检测物种及数量: 

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病毒方向

2019年11月底在武汉最初报道发现、目前仍在全球范围内肆虐的新冠疫情COVID-19,其研究很快得到突破,它的治病机理很快就被研究报告。这要得益于10×Genomics单细胞测序的功劳。通过10×Genomics 单细胞平台,COVID-19的致病病毒SARS-CoV-2通过对样本分离后10×Genomics 单细胞仪器上进行单细胞捕获分离后,进行分型分析,同时鉴定出ACE2这个蛋白在SARS-CoV-2病毒侵染致病过程中起到重要的作用。

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图:ACE2在组织中的分布

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肿瘤方向

10×Genomics在疾病、肿瘤上的应用也是十分广泛。10×Genomics平台只需要很少的样本,就能得到通量高、信息优的表观信息结果。结直肠癌、胶质母细胞瘤、非小细胞肺癌、小细胞肺癌、鳞状细胞癌、乳腺癌、肝内胆管癌、卵巢畸胎瘤、膀胱癌、淋巴癌、肺腺癌、黑色素瘤、多灶性回肠神经内分泌瘤、鼻咽癌、尤文氏肉瘤、胰腺癌等多种肿瘤都在10×Genomics平台上有相应研究。10×Genomics单细胞平台能鉴定肿瘤细胞异质性,在细胞分群、细胞marker鉴定、拟时序分析等都能很好的分析,同时细胞之间的通讯、配体受体的交流都能通过10×Genomics单细胞平台分析得到。

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图:细胞通讯

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植物方向

植物样本在10×Genomics平台上也有相应的研究。目前单细胞只在模式生物拟南芥和玉米中有研究。但是相信科技进步,植物单细胞的研究会越累越多。

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图:拟南芥根细胞异质性

爱基百客生物科技有限公司自有10×Genomics单细胞平台,并且拥有多年表观实验经验。各种各样样本的处理经验,能为我们的10×Genomics单细胞平台技术添砖加瓦。10×Genomics 单细胞转录组、单细胞ATAC、单细胞基因组学、空间转录组等,不一样的单细胞实验技术任君采撷!


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关键词:scRNA-seq,单细胞,10XGenomics

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