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近些年,单细胞测序技术发展迅猛。好的技术给科研带来了更为丰富、精准的数据,毫无疑问单细胞技术登上了生命科学的热搜榜。
2018年单细胞技术被Science评选为10大科学突破之一。2019年单细胞组学技术入选Nature年度技术。单细胞测序技术(single cell sequencing)是指在单个细胞水平上,对基因组、转录组、表观组进行高通量测序分析的一项新技术,它能够弥补传统高通量测序的局限性,揭示单个细胞的基因结构和基因表达状态,反映细胞间的异质性。
技术原理:
10X Genomics 单细胞测序的技术核心利用「微流控芯片」对细胞进行精确区分,通过「10x Barcodes」标记每一个细胞,能实现大规模的单细胞转录组测序,从而更高分辨率地揭示宏观上细胞间细胞种类的区别及每种种类的量的区别、微观上每个细胞内部的基因表达量上的区别以及其在微环境中的功能情况,在细胞异质性研究中表现出色。
利用10x Genomics 单细胞测序设计:
细胞数量是单细胞测序的首要考量因素,经费充足的情况下,样本数量越多,文章的分数也相对有所提高。样本尽可能取的多且尽可能复杂,就不会出现雷同课题。
是否需要生物学重复?
以单细胞转录组测序为例,生物学重复是好的,但也并不是必须的。需要综合考虑研究项目、样本类型和总细胞量。一般分为以下几种情况:
1、每个细胞代表了一个生物学重复;
2、不同样本解释了特定生物学过程的差异,生物学重复很重要;
3、一个样本的多个重复来增加研究中的细胞总数;
4、混合不同样本中的细胞以覆盖所研究细胞群体。
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