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10×Genomics单细胞转录组测序优缺点

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10×Genomics单细胞转录组测序优缺点

发布日期:2021-02-20 作者: 点击:

  10×Genomics单细胞转录组测序优点

  简单便捷:集单细胞分选、扩增、建库于一体,自动化程度高,无需人工操作。

  细胞通量高:微流体“双十字”交叉系统为8通道系统,每个通道最高可捕获10000个细胞,8通道一次可检测样本细胞数可达500-80000个。

  细胞捕获效率高:单细胞捕获效率高达65%,可准确鉴别稀有细胞类型,利于稀有样本或小细胞量类型样本研究。

  周期短:理论上1天即可完成细胞悬液制备、单细胞捕获、扩增及建库的所有的测序准备工作。

  真正意义的单细胞测序:单个GEMs捕获到多个细胞的概率极低(<0.9%/1000cells)。

  性价比高:与其它单细胞测序平台相比,性价比更高。

  细胞可适性高:对细胞大小(直径超过40μm细胞需要制备细胞核)及细胞类型(组织类细胞、免疫细胞、血液细胞、癌组织细胞、神经类细胞等)无限制。

10×Genomics单细胞

  10×Genomics单细胞转录组测序缺点

  只分析带poly(A)的RNA。

  样本要求高:单个样本细胞起始量达105-106个,活细胞数目至少超过80%,最好在90%以上。

  非全长信息:只能获得3’端转录本信息。

  DNA建库操作步骤较多。

  10×Genomics单细胞转录组测序应用

  3’端单细胞转录组测序

  基因组组装应用

  免疫组库测序

  ATAC-seq

  人全基因组及全外显子组测序

本文网址:http://www.igenebook.com/news/569.html

关键词:10×Genomics单细胞

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