10×Genomics单细胞转录组测序应用以及优缺点

发布日期：2021-03-18 作者：点击：

　　10×Genomics单细胞转录组测序应用

　　免疫组库测序

　　ATAC-seq

　　人全基因组及全外显子组测序

　　3’端单细胞转录组测序

　　基因组组装应用

　　10×Genomics单细胞转录组测序优点

　　周期短：理论上1天即可完成细胞悬液制备、单细胞捕获、扩增及建库的所有的测序准备工作。

　　真正意义的单细胞测序：单个GEMs捕获到多个细胞的概率极低（＜0.9%/1000cells）。

　　性价比高：与其它单细胞测序平台相比，性价比更高。

　　简单便捷：集单细胞分选、扩增、建库于一体，自动化程度高，无需人工操作。

　　细胞通量高：微流体“双十字”交叉系统为8通道系统，每个通道最高可捕获10000个细胞，8通道一次可检测样本细胞数可达500-80000个。

　　细胞捕获效率高：单细胞捕获效率高达65%，可准确鉴别稀有细胞类型，利于稀有样本或小细胞量类型样本研究。

　　细胞可适性高：对细胞大小（直径超过40μm细胞需要制备细胞核）及细胞类型（组织类细胞、免疫细胞、血液细胞、癌组织细胞、神经类细胞等）无限制。

10×Genomics单细胞转录组

　　10×Genomics单细胞转录组测序缺点

　　非全长信息：只能获得3’端转录本信息。

　　DNA建库操作步骤较多。

　　只分析带poly(A)的RNA。

　　样本要求高：单个样本细胞起始量达105-106个，活细胞数目至少超过80%，最好在90%以上。

本文网址：http://www.igenebook.com/news/574.html

关键词：10×Genomics单细胞

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