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10x Genomics植物单细胞文章集锦

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10x Genomics植物单细胞文章集锦

发布日期:2021-07-23 作者: 点击:

  单细胞测序技术已然是当下的研究热点,之前所有的Total RNA测序的样本,都可以用来做单细胞测序,以更高的分辨率解析动植物的分子机制,助力科研工作者们更加高效,快速的取得好的实验成果,发表高分文章。换句话说,单细胞测序的时代已经到来,您准备好了吗?


  10x Genomics作为单细胞测序领域的领头羊,不断致力于单细胞测序技术的优化和新应用的开发,连年上榜The Scientist Top10,强力推动单细胞测序时代的快速发展。目前10x Genomics已经助力全球客户发表了2100+篇高分文章,其中大部分是集中在人类健康方面的研究。但是,近两年来,单细胞测序在植物上的应用也崭露头角。接下来小编整理了一些利用10x Genomics平台已经发表的植物单细胞测序文章,希望对研究植物的老师有所启发。


  单细胞RNA测序(scRNA-seq)已广泛应用于动物细胞异质性的研究,但尚未广泛应用于植物的相关研究,本文是全球首篇植物高通量单细胞测序文章。本研究利用10x Genomics的单细胞测序平台,从拟南芥(Arabidopsis thaliana)根细胞的原生质体中获得7552个单细胞转录组。作者利用86个已知的根组织细胞特异性maker基因在转录组中的表达情况划分为9个单细胞类群,发现无论是主要的根组织类群,还是特定组织中的特异细胞类型都能在这9个类群中被有效检测到。此外,进一步鉴定出不同的亚群和稀有细胞类型,包括假定的静止中心细胞。对根表皮细胞转录组的拟时序分析,定义了根毛和非毛细胞分化发育轨迹。此外,对根表皮突变进行单细胞转录组测序,以单细胞分辨率对rhd6(根毛细胞缺陷)和gl2(非毛细胞缺陷)两种突变体的根组织基因表达进行比较分析,并为突变基因的影响提供了前所未有的视角。总体而言,这项研究证明了scRNA-seq在植物中的可行性和实用性,并以单细胞分辨率提供了拟南芥根的首张基因表达图谱。

本文网址:http://www.igenebook.com/news/601.html

关键词:10xGenomics,10×Genomics单细胞

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