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  • 甲基化修饰检测|说说Dot blot实验那些事

    甲基化修饰检测近些年来一直是国自然大热方向,从最开始的5mC的甲基化修饰到后来的6mA修饰,检测手段也日新月异,检测的灵敏度也一直在突破。目前大家应用最多的检测甲基化的手段主要是通过高通量测序技术,如5mC检测用到的WGBS、RRBS、me
    发布时间:2021-03-02   点击次数:10

  • 下一代测序技术在分子标记的应用

    SSR分子标记由于具有成本低廉、容易操作等特性,使其在分子标记辅助育种开发中应用广泛,但是,SSR筛选多态性标记的效率较低,并且有SSR位点多态性位点少的局限性。在下一代测序技术高速发展之前,大多数科研者开发SSR标记可能基于一代测序或者通
    发布时间:2021-02-04   点击次数:12

  • 单细胞转录组测序三种方法

      单细胞基因组测序目前主要有两种扩增方法:MALBAC方法及MDA方法,而单细胞转录组目前主要有三种方法:SMART扩增技术、10×genomics技术及Andeplete技术。今天主要和大家比较下单细胞转录组测序的三种常用方法。    
    发布时间:2020-10-29   点击次数:67

  • 10×Genomics|单细胞转录组之样品预处理

    前面我们简单介绍了10×Genomics单细胞总体,今天我们来详细讲解讲解单细胞整个实验流程。我们想要做成功的完成一个单细胞的实验,并不是那么的容易,10×Genomic平台捕获单细胞要求细胞无粘连(成团率<5%)、细胞活性不低于85
    发布时间:2020-09-11   点击次数:81

  • 单细胞疑难样本“救世主”:单核转录组snRNA-seq横空出世

    浅谈单核转录组NO.1单细胞发展历程单细胞技术的发展为人类探索细胞与细胞之前的关联提供了可能。随着单细胞的发展,从最开始的单个单个的细胞单独建库测序,到开始实现几个细胞、几百个细胞,到现在一次性捕获几千个甚至上万个细胞,几年之间,这种跨越式
    发布时间:2020-08-28   点击次数:494

  • “色彩斑斓”的10×Genomics单细胞平台

    自10×Genomics单细胞仪器问世以来,各种单细胞相关文章如火如荼发表。疾病机制解析、分子marker鉴定、细胞分化时序分析等等问题迎刃而解,人们对肿瘤的认识更透彻。通过10×Genomics单细胞平台进行实验的物种和组织样本多种多样,
    发布时间:2020-08-20   点击次数:40

  • 转录组断层技术可对脑部疾病的基因表达进行三维成像

    近日,来自日本一个研究小组开发出了一种新型技术,可以对大脑结构中的基因表达样式进行三维成像,这种技术俗称为转录组断层技术,其结合了组织切片的微阵列技术,可以都对脑部基因表达的密度和位置进
    发布时间:2020-06-11   点击次数:40

  • Cistrome DB:人和小鼠的ChIP-seq数据库

    CistromeDB是一个较为全面且公开的人类和小鼠ChIP-seq及开放染色质信息资源数据库。其中的数据囊括了NCBI、ENCODE和一些表观基因组学项目样本中相关信息
    发布时间:2020-05-20   点击次数:1031

  • 启动子查找以及转录因子结合位点预测

    启动子是RNA聚合酶识别、结合和开始转录的一段DNA序列,它含有RNA聚合酶特异性结合和转录起始所需的保守序列,多数位于结构基因转录起始点的上游,启动子本身不被转录,但他能通过与
    发布时间:2020-05-15   点击次数:488

  • 动物转录因子数据库Animal TFDB动物转录因子数据库Animal TFDB

    转录因子(Transcriptionfactors,TFs)在调控基因表达中起着关键的作用。随着被鉴定TFs越来越多,系统性识别和注释以及汇总,再进一步的构建TFs相关数据库,成为研究
    发布时间:2020-05-09   点击次数:865

  • JASPAR数据库使用

    转录因子(Transcriptionfactors,TFs)在控制基因表达中起着关键的作用。对TFs的系统性识别和注释,随后是TF数据库的构建,可能充当了研究转录因子的功能和进化的有用资源。JASPAR(http://jasp
    发布时间:2020-05-08   点击次数:218

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