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  • 10×Genomics单细胞转录组测序优缺点

      10×Genomics单细胞转录组测序优点  简单便捷:集单细胞分选、扩增、建库于一体,自动化程度高,无需人工操作。  细胞通量高:微流体“双十字”交叉系统为8通道系统,每个通道最高可捕获10000个细胞,8通道一次可检测样本细胞数可达
    发布时间:2021-02-20   点击次数:28

  • 人类细胞图谱计划与单细胞测序:空间转录组

      空间转录组是继单细胞RNA测序之后比较热门的一项技术,大家用的scRNA分析软件Seruat一开始也有预测细胞空间位置的功能。从19年开始,陆续有非常多的技术发布,这篇文章对这些技术做一个简单的梳理,文章内容来自于3篇2020年发表的综
    发布时间:2021-01-25   点击次数:20

  • 基于单细胞测序数据构建细胞转换轨迹方法综述

      在各种生物系统中,细胞会表现出一系列不同的状态(如基因表达的动态变化等。),而这些状态会按照一定的时间顺序发生变化。最典型的例子是细胞分化,从未成熟细胞逐渐分化为成熟细胞。此外,当细胞受到外界刺激或干扰时,细胞中基因的表达也可能发生一系
    发布时间:2021-01-12   点击次数:28

  • ScRNA-Seq(下)|单细胞数据如何降维?

      近年来,肿瘤免疫治疗发展迅速,受到人们的高度期待。然而,评估一种疗法不仅取决于疗效,还取决于副作用。以药物开发中常用的IC50(半抑制浓度)为例,人们更喜欢用小剂量达到治疗效果,往往大剂量意味着副作用更多。那么,免疫疗法真的像看上去那么
    发布时间:2020-12-25   点击次数:30

  • 用新方法了解基因表达噪音的来源

      在一项新的研究中,美利坚合众国德拉华大学电子和计算机工程助理教授AbhyudaiSingh描述了一种理解基因表达中“噪音”来源的新方法,这种噪音导致蛋白水平的变化。相关研究结果最近发表在《分子系统生物学》杂志上。  了解哪
    发布时间:2020-12-11   点击次数:24

  • 单细胞RNA-seq的简介

      单细胞RNA-seq(Single-CellRNASequencing)是在单细胞水平对mRNA进行高通量测序的技术,可以研究单个细胞内的基因表达情况。它是针对单个细胞的RNA水平进行测序的一门技术。  因为,即使来源相同的单个细胞
    发布时间:2020-11-27   点击次数:30

  • 单细胞转录组技术进展

      单细胞转录组领域这几年的发展突飞猛进,我们从2015年同一期的两篇cell开始然后再加上2016年的naturecommunication。第一篇cell名叫Drop-seq,其过程和原理如图1所示,首先就是给一个bead表面合成无数
    发布时间:2020-11-13   点击次数:22

  • scRNA-seq&scATAC-seq揭示如何刺激新生毛囊

      在深层皮肤损伤后,哺乳动物的进化为了加速伤口愈合,会产生纤维化疤痕。我们无法再生功能性真皮以及一些功能附属物是人类皮肤伤口愈合的主要障碍。有趣的是,一些组织拥有再生的能力,例如全层切除皮肤伤口后的新生毛囊(HF)形成已经在小鼠中被证明,
    发布时间:2020-11-11   点击次数:61

  • scRNA-seq|为什么要选择单细胞核RNA测序而非单细胞RNA测序?

      为什么要选择单细胞核RNA测序而非单细胞RNA测序    ——单细胞核RNA测序的优势!    单细胞RNA测序技术的高通量和敏感性使其非常适合于全面绘制细胞状态的变化。但是在肾脏和其他固体组织中(尤其是对于高上皮含量的组织,以及以细胞
    发布时间:2020-10-16   点击次数:28

  • 研究思路|单细胞转录组测序结合单细胞ATAC测序

      单细胞测序技术因能解决细胞异质性问题,在肿瘤研究、免疫学研究、神经生物学研究、发育研究等领域得到了充分应用,近年来发展迅速。  单细胞ATAC序列是一种在单细胞水平上研究染色质开放度的技术,主要用于转录调控序列的检测。将单细胞转录组测序
    发布时间:2020-09-21   点击次数:169

  • 10X Genomics技术原理是怎么样的?

      近些年,单细胞测序技术发展迅猛。好的技术给科研带来了更为丰富、精准的数据,毫无疑问单细胞技术登上了生命科学的热搜榜。    2018年单细胞技术被Science评选为10大科学突破之一。2019年单细胞组学技术入选Nature年度技术。
    发布时间:2020-09-14   点击次数:38

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