案例解析
《miR-155结合图揭示了广泛的非典型MicroRNA靶向情况》
Transcriptome-wide miR-155 Binding Map Reveals Widespread Noncanonical MicroRNA Targeting. Molecular Cell, 2012, 48(5):760-770.(IF=14.548)
研究背景:
microRNAs (miRNAs)是基因调控的重要组成部分,但miRNA靶标的识别仍是一个重大挑战。大多数的靶标预测和发现依赖于miRNA种子序列与3’ -UTR的完美互补。然而,目前尚不清楚没有种子序列的miRNAs在多大程度上靶向位点。
研究结果:
在T细胞中,通过CLIP-seq鉴定了Argonaute蛋白结合的RNA,结果表明40% miR-155依赖的 Argonaute结合都遵循严格的碱基配对原则,但是大多数结合的时候,都会有1个碱基的错配,有利于深入了解miRNA调控基因表达的分子机制。

图:差异剪接序列识别miR-155介导的Argonaute结合位点