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ChIP-seq

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ChIP-seq

  • 所属分类:表观组学技术

  • 点击次数:
  • 发布日期:2018/11/20
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详细介绍

将染色质免疫共沉淀技术(Chromatin immunoprecipitation assay, ChIP)与第二代测序技术(Next-Generation Sequencing, NGS)相结合的染色质免疫共沉淀测序技术(Chromatin immunoprecipitation Sequencing, ChIP-seq),能够高效地在全基因组范围内检测与组蛋白、转录因子等互作的DNA区段,是研究体内转录因子和靶基因启动子区域直接相互作用的方法,对于调控蛋白在基因组上的结合靶点筛选、差异化表观遗传变异的原理揭示提供了重要的解决思路。

 

技术流程

 ChIP-seq

 

技术优势

1. 丰富的项目经验,研究物种多达50+种,累计实验5000余次

基因表达定量

2. 完善的实验平台,高质量的进口试剂

基因表达调控 


3. 微量建库,建库起始量低至Pg级

基因表达调控 


4. 分析云计算,分析时间短至3d,交互式体验

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结果展示


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图1 reads可视化

 

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图2 reads分布统计

 


研究体内转录因子和靶基因启动子区域直接相互作用

研究体内转录因子和靶基因启动子区域直接相互作用

图3 peaks分布统计

 


研究体内转录因子和靶基因启动子区域直接相互作用

研究体内转录因子和靶基因启动子区域直接相互作用

图4 peaks关联基因GO、KEGG富集



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图5 motif预测


本文网址:http://www.igenebook.com/product/573.html

关键词:基因表达调控,基因表达定量,表观组学技术服务

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