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长链非编码RNA(Long non-coding RNA, lncRNA)是长度大于 200 个核苷酸的非编码 RNA。研究表明, lncRNA 在表观遗传调控、细胞周期调控和细胞分化调控等众多生命活动中发挥重要作用。
技术原理
利用高通量测序技术进行lncRNA测序,并结合生物信息学的预测工具进行lncRNA分析,,分析lncRNA与特定生物学过程的关系。该方法可以更加高效地获取lncRNA序列以及位置信息,且突破了常规lncRNA芯片检测技术的使用范围限制,还可对新的lncRNA进行预测及功能分析,极大促进lncRNA的深入研究。
技术流程
分析流程
样品要求
Total RNA:≥2 μg ,浓度≥100ng/μl
OD260/280为1.8-2.2
适用范围:有参考基因组物种;
案例分享
通过对五个不同花粉发育阶段表达的lncRNA进行测序分析,鉴定了白菜花粉发育和授粉受精过程中表达的lncRNA,并通过lncRNA、miRNA和mRNA联合分析解析白菜雄性育性潜在调控机制。
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