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MeDIP-Seq

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MeDIP-Seq

  • 所属分类:表观组学技术

  • 点击次数:
  • 发布日期:2018/11/20
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详细介绍

DNA甲基化是表观遗传学的热点研究领域,在调控基因转录、传递基因组印记、维持染色质结构、调控胚胎发育以及肿瘤等疾病发生中发挥关键作用。甲基化DNA免疫共沉淀测序(MeDIP-Seq)作为全基因组DNA甲基化测定的方法有其独特的优势。

 

技术原理

MeDIP-Seq(Methylated DNA Immunoprecipitation Sequencing),即采用甲基化DNA免疫共沉淀技术,通过5'-甲基胞嘧啶抗体特异性富集基因组上发生甲基化的DNA片段,然后通过高通量测序可以以较小的数据量,快速高效地寻找基因组上的甲基化区域,从而比较不同细胞、组织、不同样本间的DNA甲基化修饰模式的差异。

 

技术流程

表观组学技术服务 

 

分析流程

基因表达定量 

 

样品要求

gDNA≥25ug;浓度≥50ng/ul且≥20ul;条带完整,无降解,无杂质污染

 

案例分享

两个拟南芥品种Col- gl和Ler各自的胚和胚乳为材料,利用MeDIP-seq的技术对全基因组的甲基化谱进行研究,研究发现伴随着胚乳的发育以及胚乳特异的一些基因的表达发生了大规模甲基化的变化。

基因表达调控 

 

参考文献:

Gehring, M., Bubb, K. L., & Henikoff, S. (2009). Extensive demethylation of repetitive elements during seed development underlies gene imprinting. Science, 324(5933), 1447-1451. doi: 10.1126/science.1171609.


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关键词:表观组学技术服务,基因表达定量,基因表达调控

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