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Small RNA-seq

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Small RNA-seq

  • 所属分类:高通量转录调控技术

  • 点击次数:
  • 发布日期:2018/11/20
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详细介绍

小RNA主要包含miRNA 、piRNA 、siRNA、snoRNA等RNA分子。小RNA参与基因表达与调控、RNA的加工与剪切、蛋白质翻译、遗传“入侵”抑制、配子发生等重要生物学过程,是生命活动中必不可少的调控因子。小RNA中主要组成的是微小RNA(microRNA, 简称miRNA),可通过识别靶mRNA 实现转录后的基因调控。研究表明, 包括癌症、心血管疾病、免疫系统疾病在内的多种疾病与miRNA 的调控作用密切相关。

 

技术原理

小RNA测序通过将18-30 nt范围的小RNA从总RNA中分离出来,两端分别加上特定接头后体外反转录做成cDNA再做进一步处理后,利用测序仪对DNA片段进行单向末端直接测序。通过对小RNA大规模测序分析,可以从中获得物种全基因组水平的小RNA表达信息。

 

技术流程

基因表达定量 

 

分析流程

小RNA 

 

样品要求

总RNA≥1.5ug;RNA样品浓度≥250 ng/ul;

 

测序平台策略

BGI平台;SE50

 

案例分享

研究利用高通量测序手段研究了CMA(牛奶过敏)中起关键调节作用的 miRNA及其靶基因,为CMA发病诊断和治疗策略提供了新思路。研究者选取了4-18个月的儿童中获得的外周血单核细胞:10例CMA患者和11例健康对照者,构建了smallRNA测序文库。miR-193a-5p可能在IgE介导的CMA中起作用。这个miRNA可能成为儿童时期食物过敏常见形式的一种新的诊断和治疗靶点。


 

表观组学技术服务

基因表达调控



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关键词:基因表达定量,表观组学技术服务,基因表达调控

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