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绝对定量转录组测序

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绝对定量转录组测序

  • 所属分类:高通量转录调控技术

  • 点击次数:
  • 发布日期:2018/11/20
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详细介绍

常规转录组测序由于文库存在PCR扩增偏好性,所有序列并不会被同比例放大,因而造成测序定量结果与样本中转录本的原始丰度不一致,导致差异基因筛选不准确。这也是造成qPCR验证测序结果不一致的主要原因。武汉爱基百客生物推出的绝对定量转录组测序消除PCR扩增偏好对定量的干扰,真实反映样本中转录本的表达丰度。


技术原理

在文库扩增之前为每一条RNA片段加上唯一的身份标签(Unique Identifier,UID),同一片段扩增产物均带有相同的标签,而天然重复片段则带有不同的标签。测序完成后利用UID过滤数据,将相同标记的扩增产物进行合并,就能准确去除PCR扩增重复、同时保留样本的天然重复,在此过程中,PCR扩增和测序错误同样可以被纠正。


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技术流程


基因表达调控

基因表达定量


样品要求

1、 细胞样本:3 X 10^6~1 X 10^7个

2、 动物组织:1-2g

3、 植物组织:3-4g(100mg左右分装)

4、 RNA:请提供≥15μg,OD260/280=1.8~2.2,OD260/230≥2.0,浓度≥400ng/μl,28S:18S≥1.0,23S:16S≥1.5;




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关键词:表观组学技术服务,基因表达调控,基因表达定量

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