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转录组测序

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转录组测序

  • 所属分类:高通量转录调控技术

  • 点击次数:
  • 发布日期:2018/11/21
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详细介绍

转录组(transcriptome)广义上指某一生理条件下,细胞内所有转录产物的集合,包括信使RNA、核糖体RNA、转运RNA及非编码RNA;狭义上指所有mRNA的集合。蛋白质是行使细胞功能的主要承担者,蛋白质组是细胞功能和状态的直接描述,转录组成为研究基因表达的主要手段,转录组是连接基因组遗传信息与生物功能的蛋白质组的必然纽带,转录水平的调控是目前研究很多的,也是生物体重要的调控方式。

 

技术原理

提取总RNA反转录成为cDNA,再通过新一代高通量测序,能够全面快速地获得某一物种特定组织或器官在某一状态下的几乎所有转录本序列信息,已广泛应用于基础研究、临床诊断和药物研发等领域。

 

技术流程:

表观组学技术服务 

 

分析流程

基因表达调控 

样品要求

1、 细胞样本:3 X 10^6~1 X 10^7个

2、 动物组织:1-2g

3、 植物组织:3-4g(100mg左右分装)

4、 RNA:请提供≥15μg,OD260/280=1.8~2.2,OD260/230≥2.0,浓度≥400ng/μl,28S:18S≥1.0,23S:16S≥1.5;

 

案例分享

生理和转录组测序分析,发现不同光谱的组合更有利于调节马铃薯生长。在三个样品中共发现2220个差异表达基因(DEG),并分析了三个比较组中的DEG。与对照条件相比,在红光(红色)和蓝光(蓝色)条件下分别鉴定出总共1180和984个差异基因表达。在这些DEG中,涉及光合作用的四个基因和涉及色素合成的两个基因高度表达

 

 


基因表达调控

基因表达定量

基因表达定量

 

文章链接:https://dx.doi.org/10.1007/s13205-018-1410-0


本文网址:http://www.igenebook.com/product/584.html

关键词:基因表达调控,基因表达定量,表观组学技术服务

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