CUT&Tag

CUT&Tag是蛋白-DNA互作的一大革新技术，它不需要使用甲醛交联以及免疫共沉淀，而是通过针对靶蛋白（如转录因子、染色质重塑蛋白）的抗体和Protein A的介导，使得与Protein A融合的Tn5酶(Tagmentase)在切割DNA片段的同时在序列两端加上测序接头，经PCR扩增后形成可以直接用于高通量测序的文库.

技术原理：

在抗体引导下，ChiTag酶仅在目的组蛋白修饰标志、转录因子或染色质调控蛋白结合染色质的局部进行目的DNA的片段化，同时添加测序接头，并释放到细胞外。由于绝大部分无关的染色质还留在细胞核内，因此整个实验的信噪比大幅提高，同时简化了实验步骤。

技术流程：

CUT&Tag与ChIP-seq的比较：

对于测序后分析的结果，CUT&Tag也能与ChIP-seq一样得到相似的峰，并且背景更低，信噪比更好：

参考文献：Hatice S. Kaya-Okur, Steven J. Wu, Christine A. Codomo, Erica S. Pledger, Terri D. Bryson, Jorja G. Henikoff, Kami Ahmad & Steven Henikoff. CUT&Tag for efficient epigenomic profiling of small samples and single cells. Nature communications. 2019, 10(1):1930.