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CUT&Tag

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CUT&Tag

  • 所属分类:表观组学技术

  • 点击次数:
  • 发布日期:2019/12/11
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详细介绍

CUT&Tag是蛋白-DNA互作的一大革新技术,它不需要使用甲醛交联以及免疫共沉淀,而是通过针对靶蛋白(如转录因子、染色质重塑蛋白)的抗体和Protein A的介导,使得与Protein A融合的Tn5酶(Tagmentase)在切割DNA片段的同时在序列两端加上测序接头,经PCR扩增后形成可以直接用于高通量测序的文库.


技术原理:

在抗体引导下,ChiTag酶仅在目的组蛋白修饰标志、转录因子或染色质调控蛋白结合染色质的局部进行目的DNA的片段化,同时添加测序接头,并释放到细胞外。由于绝大部分无关的染色质还留在细胞核内,因此整个实验的信噪比大幅提高,同时简化了实验步骤。

图片2.png

技术流程:

图片3.png


CUT&Tag与ChIP-seq的比较:

1.png


对于测序后分析的结果,CUT&Tag也能与ChIP-seq一样得到相似的峰,并且背景更低,信噪比更好:

图片4.png

参考文献:Hatice S. Kaya-Okur, Steven J. Wu, Christine A. Codomo, Erica S. Pledger, Terri D. Bryson, Jorja G. Henikoff, Kami Ahmad & Steven Henikoff. CUT&Tag for efficient epigenomic profiling of small samples and single cells. Nature communications. 2019, 10(1):1930.


本文网址:http://www.igenebook.com/product/585.html

关键词:转录因子,ChIP-seq,组蛋白修饰

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