Q1: 请问宏基因组16sDNA测序与宏全基因组测序有什么区别？

A1:宏基因组微生物分类测序只测环境样品中一个基因（分子标记基因），而宏全基因组测序是随机测环境样品中所有的DNA；前者可以得到环境内物种组成情况，后者侧重了解环境中不同的功能基因组成情况，代谢途径。 通常情况下，在微生态研究中，建议将宏基因组16sDNA测序与宏全基因组测序相结合，可以更准确、全面的了解微生物菌落结构及功能情况。

Q1、甲基化检测方法选择？

A1：甲基化分为DNA甲基化和RNA甲基化，DNA甲基化又分为5mC和6mA。常用检测DNA的5mC方法有：WGBS（Busulfite-seq）、RRBS-seq、MeDIP-seq，而检测DNA的6mA方法为6mA-IP-seq。检测RNA甲基化的方法为m6A-IP-seq。每个方法各有千秋，WGBS（Busulfite-seq）、RRBS-seq能达到单碱基分布，但是相对来说成本会高，MeDIP-seq只能达到50bp碱基分布，但是相对费用较小。

Q1：什么是ATAC-seq？

A1：ATAC-seq (Assay for Transposase Accessible Chromatin with high-throughput sequencing) 是利用转座酶研究染色质活性区域，结合高通量测序技术发展出来的新技术。Tn5转座体可将其衔接子负载整合到可接近的染色质区域，而空间位阻较不可接近的染色质使得转座不可能发生，从而获得全基因组染色质开放图谱、转录因子结合及核小体定位等关键信息。