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武汉爱基百客生物科技有限公司(简称爱基百客),位于武汉高农生物园,办公面积逾3000m2,是一家专业提供单细胞与空间组学测序分析、表观组学科研服务和高通量测序分析的新型生物科技服务企业。

公司旨在为客户提供最专业的科研服务,运营至今合作的科研客户近千家,涵盖国内知名科研院所、高校以及相关生物企业,运营至今销售额超1亿元,科研成果曾多次在Cancer Cell、Plant Cell、Nature Communications、J HEMATOL ONCOL等国际高水平学术期刊发表,受到了客户广泛好评,是国内成长最迅速的高通量测序科研服务企业之一。

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详细说明

全基因组甲基化测序

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  • 案例分析

全基因组甲基化测序(Whole Genome Bisulfite Sequencing


产品介绍:

全基因组甲基化测序(WGBS)是利⽤重亚硫酸氢盐对全基因组DNA进⾏处理,使未甲基化修饰的胞嘧啶碱基转化为尿嘧啶碱基,然后在后续PCR过程中,尿嘧啶碱基转化成胸腺嘧啶碱基。利⽤⾼通量测序在全基因组范围内检测所有的甲基化位点,绘制单碱基分辨率的DNA甲基化图谱 。WGBS能为基因组时空特异性修饰的研究提供重要的技术⽀持,⼴泛应⽤于个体发育、衰⽼和疾病过程中表观遗传差异的作⽤机理研究中,也是各物种甲基化图谱研究的⾸选技术。

 WGBS.png



分析流程:

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技术优势

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样本要求:

细胞:≥5×106

动物组织:0.2g

植物组织3g


建库测序:

测序策略:Illumina, PE150

测序深度:30×


项目周期:

45个工作日


案例分析

【项⽬⽂章】《DNA低甲基化通过⽣⻓素和⼄烯响应途径介导桂花中花的开放和衰⽼》

DNAhypomethylationmediatesfloweropeningandsenescenceinsweetosmanthusthroughauxinandethyleneresponsivepathways

期刊:PostharvestBiologyandTechnology|影响因⼦:6.751|发表时间:2023年|发表单位:湖北科技学院


研究背景:

桂花是中国最受欢迎的⼗⼤传统花卉之⼀,被⼴泛⽤于观赏、⻝品/化妆品添加剂等。但其花期 普遍较短,最佳商业采收期仅为2-3d,极⼤地限制了其观赏价值和经济可⾏性。内源性⼄烯的产⽣是花衰⽼的重要调节因⼦。⼄烯增强了DNA碎⽚,破坏亚细胞结构,导致花瓣脱落。然⽽,桂花内源⼄烯产⽣的机制和花从开放到衰⽼的过程尚不清楚 。已有研究表明,DNA甲基化参与调控果实成熟和叶⽚衰⽼(如番茄、拟南芥等)。然⽽,DNA甲基化在调控桂花开花和衰⽼中的作⽤尚不清楚。


技术路线:

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研究结果:

本研究通过对桂花全基因组DNA甲基化和转录组谱的综合分析,揭DNA去甲基化在桂花开花过程中起着重要作⽤ 。DNA低甲基化可能通过⽣⻓素反应途径OfSAUR基因介导花开放,并通过⼄烯合成和反应途径OfERF基因介导花衰⽼。最终,作者提出了⼀种表观遗传调控三组分模型,在该模型中,花的开放和衰⽼由DNA去甲基化调控,通过介导特定基因家族的表达,以及植物激素⽣⻓素和⼄烯,将花转变为开放和衰⽼的状态。

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图:DNA低甲基化通过⽣⻓素和⼄烯反应途径介导花的开放和衰⽼



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