标题
更多

关于我们



武汉爱基百客生物科技有限公司(简称爱基百客),注册于2014年12月31日,次年10月正式开始对外运营,是一家专业提供表观组学技术服务、高通量测序、单细胞测序分析的新型生物科技服务企业。

公司总员工已达到百余人,其中95%以上具有学士学位,40%以上具有硕士及以上学位,专职科研人员20余人,专职销售人员30余人,覆盖全国90%的省市,核心成员来自国内知名高效、基因测序公司、信息分析公司等。

公司运营至今销售额累积1亿左右,成为国内成长最迅速的二代测序与生物科研服务企业之一。




加入我们

TECHNOLOGY SERVICE

科技服务

详细说明

全基因组甲基化测序

  • 产品介绍
  • 案例分析

全基因组甲基化测序(Whole Genome Bisulfite Sequencing)


产品介绍:


全基因组甲基化测序(Whole Genome Bisulfite Sequencing)是利用重亚硫酸氢盐对全基因组DNA进行处理,使未甲基化修饰的胞嘧啶碱基转化为尿嘧啶碱基,然后在后续PCR过程中,尿嘧啶碱基转化成胸腺嘌呤碱基。利用高通量测序在全基因组范围内检测所有的甲基化位点,绘制单碱基分辨率的DNA甲基化图谱。WGBS能为基因组时空特异性修饰的研究提供重要的技术支持,广泛应用于个体发育、衰老和疾病过程中表观遗传差异的作用机理研究中,也是各物种甲基化图谱研究的首选技术。

 1649953597188324.png

▲Busulfite-seq测序基本原理


技术路线:

 1651820144361777.jpg


样本要求:

基因组DNA2 μg

样品浓度:≥40 ng/μl

DNA纯度:OD260/OD280=1.8-2.0OD260/OD230大于2.0,琼脂糖凝胶电泳检测主带大约23Kb,无拖尾无降解,无蛋白污染。


建库测序:

测序策略:Illumina Hiseq, PE150

测序深度:30×


项目周期:

45个工作日


案例分析

《靶向阻断人胚胎干细胞中的DNMT1、DNMT3A和DNMT3B》

Targeted disruption of DNMT1, DNMT3A and DNMT3B in human embryonic stem cells. Nature genetics. 47:469–478 (2015)(IF=31.616)


研究背景:

DNA甲基化是调控基因表达和维持基因组完整性的关键表观遗传修饰。在此,作者使用CRISPR/Cas9基因组编辑技术灭活了人类胚胎干细胞(ESCs)中所有三种催化活性的DNA甲基转移酶(DNMTs),以进一步研究这些酶的作用和基因组上的靶点。


研究结果:

WGBS-seq结果发现,单独阻断DNMT3ADNMT3B,以及两种酶的串联阻断产生可存活的多能性细胞系明显影响了其DNA甲基化。令人惊讶的是,与小鼠实验结果相反,DNMT1的缺失导致了人类ESCs细胞的快速死亡。为了克服这种直接致死率,我们产生了一个对多西环素敏感的tTA-DNMT1拯救系,并很容易获得纯合的DNMT1突变系。然而,多西环素介导的外源性DNMT1的抑制启动了DNA甲基化的快速、全局性损失,随后引发了广泛的细胞死亡。我们的数据提供了DNMT突变型ESCs的全面特征,包括针对这些酶的单碱基全基因组图谱。

图片3.png

▲全基因组甲基化动态变化情况



         询服务热线


027-87606602


(市场部

027-62431231


(行政部





联系我


Q Q: 270105245   1511879086   465436937           

传真: 027-87606602

邮箱: support@igenebook.com

地址:武汉市东湖高新区高新大道888号高农生物二期3A栋

网址: www.igenebook.com


公司主要提供表观组学技术服务、NGS测序服务、单细胞测序服务

欢迎咨询!鄂ICP备17016573号-2   技术支持:武汉网站建设

关注我们

二维码

公众号二维码



客服中心
联系方式
027-87606602
- 线上客服
微信 一对一业务咨询
×