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武汉爱基百客生物科技有限公司(简称爱基百客),注册于2014年12月31日,次年10月正式开始对外运营,是一家专业提供表观组学技术服务、高通量测序、单细胞测序分析的新型生物科技服务企业。

公司总员工已达到百余人,其中95%以上具有学士学位,40%以上具有硕士及以上学位,专职科研人员20余人,专职销售人员30余人,覆盖全国90%的省市,核心成员来自国内知名高效、基因测序公司、信息分析公司等。

公司运营至今销售额累积1亿左右,成为国内成长最迅速的二代测序与生物科研服务企业之一。




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TECHNOLOGY SERVICE

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详细说明

CUT&tag

  • 产品介绍
  • 案例分享

CUT&tag ( Cleavage Under Targets and Tagmentation )


产品介绍:

CUT&Tag是蛋白质-DNA互作关系研究的新方法,是通过针对靶蛋白(如转录因子、染色质重塑蛋白)的抗体和Protein A的介导,使得与Protein A融合的Tn5(Tagmentase)在切割DNA片段的同时在序列两端加上测序接头,经PCR扩增后形成可以直接用于高通量测序的文库。随后文库进行测序分析,探究目的蛋白结合的DNA片段。

ChiTagProtein A蛋白与Tn5转座酶的融合蛋白,当抗体结合目的蛋白(如转录因子、组蛋白等)后,Protein A蛋白可直接结合抗体,携带的Tn5转座酶可特异性的切割目的蛋白附近的DNA片段,并将DNA片段连上接头,文库构建之后可进行高通量测序。

相对其他技术,CUT&Tag技术需要的样本量较少,并且其实验信噪比较高,背景较少

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CUT&Tag实验流程


技术流程:

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样本要求:

细胞:5×104 

动物组织:0.2 g

植物组织0.5 g

真核微生物:500 mg

 

建库测序:

测序策略:Illumina Hiseq, PE150

测序深度:6-12 G


项目周期:

90个工作日 



案例分析

《CUT&Tag解析微量样本和单细胞的表观特性》

CUT&Tag for efficient epigenomic profiling of small samples and single cells. Nature Communication, 2019, 10:1930.(IF=11.878)


研究背景:

许多染色质特征在调节基因表达中起关键作用。要完全了解基因调控,需要在高分辨率的小样本细胞中定位特定的染色质特征。转录因子、组蛋白修饰等在调控基因表达方面发挥重要作用,而对于一些低样本量的材料而言,全面了解调控模式就十分困难。


研究结果:

CUT-Tag可以应用于低细胞起始量的样本。该方法通过将染色质蛋白和特异性抗体结合,随后利用ProteinA-Tn5转座酶融合蛋白将特定区域进行捕获。通过组蛋白修饰、RNA聚合酶进行底细胞以及单细胞检测,结果显示CUT-Tag结果信噪比较好具有较强可用性。

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图:CUT&Tag技术与其他技术的对比



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