案例分析
《H3K18乳酸化标记组织特异的活性增强⼦》
H3K18lactylationmarkstissue-specifcactiveenhancers
期刊:GenomeBiol|影响因⼦:17.906|发表时间:2022年|发表单位:瑞⼠苏黎世联邦理⼯学院
研究背景:
在⼈类、⼩⿏、植物、真菌和寄⽣⾍样本中已经报道了超过30个组蛋⽩乳酸化位点。H3组蛋⽩18位的赖氨酸残基的乳酸化已经进⾏了⼀些深⼊研究,研究显⽰其在基因启动⼦上⾼度富集,并与癌细胞和巨噬细胞中的相关基因的活跃表达有关。但迄今为⽌,⼤多数的Kla的报道集中在总Kla⽔平的变化,但全基因组H3K18la分布及其与其他组蛋⽩修饰和基因表达的关系报道较少。
研究结果:
该研究利⽤CUT&Tag技术⽣成了⼩⿏和⼈组织的 H3K18la 分布的全基因组数据集,其中这些组织覆盖到多代谢状态 。监督(与公共数据重叠)和⽆监督(ChromHMM)分析反映H3K18la除了活性启动⼦,还标记组织特异的活性增强⼦。研究中还有⼀个兴奋的发现,活性CGI 启动⼦上的H3K18la 可能主要标记启动⼦嵌⼊的增强⼦序列,使得H3K18la成为与H3K27ac部分不同的组蛋⽩翻译后修饰的增强⼦标记。
图:H3K18la标记了活性的CGI 启动⼦