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武汉爱基百客生物科技有限公司(简称爱基百客),位于武汉高农生物园,办公面积逾3000平方米,是一家专注于表观组学、单细胞时空组学和高通量测序分析服务的新型生物科技企业。


公司旨在为客户提供专业的科研服务,运营至今合作的科研客户近千家,涵盖国内知名科研院所、高校以及相关生物企业,运营至今销售额超1亿元,科研成果曾多次在Science、Cancer Cell、Plant Cell、Nature Communications、J HEMATOL ONCOL等国际高水平学术期刊发表,受到了客户广泛好评,是国内成长最迅速的多组学科研服务企业之一。

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TECHNOLOGY SERVICE

科技服务

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EMSA

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EMSA(electrophoretic mobility shift assay)


产品介绍:

凝胶迁移实验是⼀种体外研究蛋白和DNA相互作用的实验。通常将纯化的蛋白和携带标记物的DNA探针⼀同孵育,在非变性的聚丙烯凝胶电泳上,DNA与蛋白结合复合物比非结合的探针移动得慢,通过探针迁移速度快慢评估⽬的蛋白与DNA是否结合。在实验上会通过冷竞争探针和突变探针进⼀步验证蛋白和DNA结合情况。


技术路线:

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样本要求:

探针序列或探针:明确的探针序列或已合成探针

纯化蛋白:1mg /ml,100μg以上(也可委托公司进行蛋白表达与纯化)

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最终交付:

实验报告:含完整的实验流程、实验结果数据及图片。


案例分享


【项⽬⽂章】《整合ATAC测序与RNA测序揭示RcHSF30通过调控sHSP和BAG实现玫瑰的热耐受性》

Integrated ATAC-seq and RNA-seq reveal RcHSF30 regulating sHSP and BAG for thermotolerance in rose

期刊:Industrial Crops & Products | 影响因⼦:6.2|发表时间:2025年|发表单位:中南林业科技大学


研究背景:

高温严重阻碍了月季在园林景观中的应用,并对切花的产量和品质产生负面影响。然而,目前关于月季热应激反应(HSR)的转录调控网络仍知之甚少。

研究结果:

研究对热胁迫下的月季(Rosa chinensis)进行了ATAC-seq和RNA-seq分析,揭示了在热暴露两小时内染色质可及性的动态变化。研究发现,启动子区域的差异可及区域(DARs)呈现下调趋势,而基因间区的DARs则呈现上调趋势。在四个时间点上,与上调DARs相关的热激活基因富集在与抗逆性相关的通路中。值得注意的是,热响应基因在其可及区域内富含大量的热休克因子(HSF)结合基序。小分子热休克蛋白基因(HSP18.1)和Bcl-2相关去乃基因(BAG6)显示出最强的染色质可及性与表达量的相关性,且在其启动子中含有HSF顺式作用元件。研究鉴定出RcHSF30(HSFA2家族成员)在热胁迫期间显著上调。分子对接分析和凝胶迁移率实验(EMSA)证实,RcHSF30能够结合到RcHSP18.1和RcBAG6的可及启动子区域。在转基因玫瑰(R. rugosa)中过表达RcHSF30增强了植株的耐热性,减少了活性氧(ROS)的积累,并上调了HSP18.1和BAG6的表达。本研究阐明了月季热应激反应背后的表观遗传调控机制,为培育耐热月季新品种奠定了基础。

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图:RcHSF30与RcHSP18.1/RcBAG 6之间的相互作用

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