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样本处理及建库系统 / 二代测序系统
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武汉爱基百客生物科技有限公司（简称爱基百客），位于武汉高农生物园，办公面积逾3000m2，是一家专业提供单细胞与空间组学测序分析、表观组学科研服务和高通量测序分析的新型生物科技服务企业。

公司旨在为客户提供最专业的科研服务，运营至今合作的科研客户近千家，涵盖国内知名科研院所、高校以及相关生物企业，运营至今销售额超1亿元，科研成果曾多次在Cancer Cell、Plant Cell、Nature Communications、J HEMATOL ONCOL等国际高水平学术期刊发表，受到了客户广泛好评，是国内成长最迅速的表观生物学、二代测序与生物科研服务企业之一。

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网站首页 >> 科技服务 >>染色质图谱 >> RIP-seq

详细说明

RIP-seq

产品介绍
案例分析

RIP-seq（RNA Immunoprecipitation sequencing）

产品介绍：

RNA免疫共沉淀（RNA Immunoprecipitation，RIP）是研究细胞内RNA与蛋白结合情况的技术， RIP利用目标蛋白的抗体将相应的RNA-蛋白复合物（RBP）沉淀下来，分离纯化捕获的RNA，结合高通量测序技术对目标RNA进行测序分析。RIP可以看成是普遍使用的染色质免疫沉淀ChIP技术的类似应用，蛋白结合对象为RNA，RIP-seq即对富集得到的RNA片段进行高通量测序，是了解转录后调控网络动态过程的有力工具，能够有效探究在基因组范围内发现与蛋白或蛋白复合物相结合的RNA。

图：RIP-seq实验流程

技术路线：

样本要求：

细胞：＞1×108个

动物组织：≥0.5 g

植物组织：≥5 g

真核微生物：1 g

建库测序：

测序策略：Illumina Hiseq, PE150

测序深度：6-12 G

项目周期：

90个工作日

案例分析

《miR-124在人类神经发生过程中的复杂调控网络》

Combined Experimental and System-Level Analyses Reveal the Complex Regulatory Network of miR-124 during Human Neurogenesis.Cell Systems,2018,438-452.（IF=8.64）

研究背景：

非编码RNA调控包括神经发生在内的许多生物过程。大脑富集的miR-124被认为是神经元分化的关键角色，因为它对数千个靶点进行调控，但是调控的靶点还不清楚。

研究结果：

利用RIP-seq鉴别得到98个高置信度miR-124的靶点，其中一些直接导致生存能力的下降。通过转录因子-网络分析，发现miR-124对细胞凋亡、神经元亚型分化和锌指转录因子的间接调控作用。

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