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样本处理及建库系统 / 二代测序系统
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武汉爱基百客生物科技有限公司（简称爱基百客），位于武汉高农生物园，办公面积逾3000平方米，是一家专注于表观组学、单细胞时空组学和高通量测序分析服务的新型生物科技企业。

公司旨在为客户提供专业的科研服务，运营至今合作的科研客户近千家，涵盖国内知名科研院所、高校以及相关生物企业，运营至今销售额超1亿元，科研成果曾多次在Science、Cancer Cell、Plant Cell、Nature Communications、J HEMATOL ONCOL等国际高水平学术期刊发表，受到了客户广泛好评，是国内成长最迅速的多组学科研服务企业之一。

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详细说明

RIP-seq

产品介绍
案例分析

RIP-seq（RNA Immunoprecipitation sequencing）

产品介绍：

RNA免疫共沉淀（RNA Immunoprecipitation，RIP）是研究细胞内RNA与蛋⽩结合情况的技术，RIP利⽤⽬标蛋⽩的抗体将相应的RNA-蛋⽩复合物（RBP）沉淀下来，分离纯化捕获的RNA，结合⾼通量测序技术对⽬标RNA 进⾏测序分析。RIP可以看成是普遍使⽤的染⾊质免疫沉淀 ChIP 技术的类似应⽤，蛋⽩结合对象为RNA，RIP-seq即对富集得到的RNA ⽚段进⾏⾼通量测序，是了解转录后调控⽹络动态过程的有⼒⼯具，能够有效探究在基因组范围内发现与蛋⽩或蛋⽩复合物相结合的RNA。

图：RIP-seq实验流程

技术路线：

RIP技术路线.png

样本要求：

细胞：≥1×107个

动物组织：≥5 g

植物组织：≥5 g

真核微生物：500mg

建库测序：

测序策略：NovaSeq6000, PE150

测序深度：6-12 G

项目周期：

45个工作日

案例分析

【项⽬⽂章】《hnRNPU是小鼠精原干细胞库建立所必需的》

hnRNPU is required for spermatogonial stem cell pool establishment in mice

期刊：Cell Reports｜影响因⼦：6.9｜发表时间：2024年｜发表单位：华中科技大学同济医学院

研究背景：

精原干细胞（SSCs）是负责精子发生的干细胞，具有自我更新和分化产生功能性精子的能力。SSCs的持续再生对于维持雄性生育力至关重要。然而，SSC池的发育起源尚不清楚。在哺乳动物中，SSCs源自名为 prospermatogonia（ProSG）的前精原细胞，依次发育为增殖型前精原细胞（M-ProSG）、初级过渡型前精原细胞（T1-ProSG）和次级过渡型前精原细胞（T2-ProSG）三种类型。ProSG的迁移和分化过程对于SSC池的建立至关重要，但这一过程的调控机制仍不完全清楚。

研究结果：

在此，我们证实了 hnRNPU 对于精原干细胞（SSC）库的建立至关重要。在雄性小鼠中，前精原细胞（ProSG）中 hnRNPU 的条件性缺失会导致精子发生停滞并引致不育。hnRNPU 缺陷型前精原细胞无法分化并迁移至基底膜，从而无法在幼年期建立 SSC 库。此外，hnRNPU 的缺失导致前精原细胞积聚，并破坏了 T1 型前精原细胞向 T2 型前精原细胞的转变过程。单细胞转录组分析显示，生殖细胞处于有丝分裂静止状态，并且在 hnRNPU 耗竭后丧失了其独特的身份特征。我们进一步表明，hnRNPU 能够结合 Vrk1、Slx4 和 Dazl 的转录本，这些转录本已被发现在 hnRNPU 缺陷的睾丸中存在异常的选择性剪接。这些观察结果为 SSC 库的建立提供了重要见解，并可能对男性生育能力具有转化医学意义。