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武汉爱基百客生物科技有限公司(简称爱基百客),注册于2014年12月31日,次年10月正式开始对外运营,是一家专业提供表观组学技术服务、高通量测序、单细胞测序分析的新型生物科技服务企业。

公司总员工已达到百余人,其中95%以上具有学士学位,40%以上具有硕士及以上学位,专职科研人员20余人,专职销售人员30余人,覆盖全国90%的省市,核心成员来自国内知名高效、基因测序公司、信息分析公司等。

公司运营至今销售额累积1亿左右,成为国内成长最迅速的二代测序与生物科研服务企业之一。




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TECHNOLOGY SERVICE

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详细说明

RIP-seq

  • 产品介绍
  • 案例分析

RIP-seq(RNA Immunoprecipitation sequencing)


产品介绍

RNA免疫共沉淀(RNA ImmunoprecipitationRIP)是研究细胞内RNA与蛋白结合情况的技术, RIP利用目标蛋白的抗体将相应的RNA-蛋白复合物RBP沉淀下来,分离纯化捕获RNA,结合高通量测序技术对目标RNA进行测序分析RIP可以看成是普遍使用的染色质免疫沉淀ChIP技术的类似应用,蛋白结合对象为RNARIP-seq即对富集得到的RNA片段进行高通量测序,是了解转录后调控网络动态过程的有力工具,能够有效探究在基因组范围内发现与蛋白或蛋白复合物相结合的RNA

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图:RIP-seq实验流程


技术路线:

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样本要求:

细胞:>1×108 

动物组织:0.5 g

植物组织5 g

真核微生物:1 g


建库测序:

测序策略:Illumina Hiseq, PE150

测序深度:6-12 G


项目周期:

90个工作日


案例分析

《miR-124在人类神经发生过程中的复杂调控网络》

Combined Experimental and System-Level Analyses Reveal the Complex Regulatory Network of miR-124 during Human Neurogenesis.Cell Systems,2018,438-452.(IF=8.64)


研究背景:

非编码RNA调控包括神经发生在内的许多生物过程。大脑富集的miR-124被认为是神经元分化的关键角色,因为它对数千个靶点进行调控,但是调控的靶点还不清楚。


研究结果:

利用RIP-seq鉴别得到98个高置信度miR-124的靶点,其中一些直接导致生存能力的下降。通过转录因子-网络分析,发现miR-124对细胞凋亡、神经元亚型分化和锌指转录因子的间接调控作用。

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图:RIP-seq分析鉴定miR-124的靶点



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