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武汉爱基百客生物科技有限公司(简称爱基百客),注册于2014年12月31日,次年10月正式开始对外运营,是一家专业提供表观组学技术服务、高通量测序、单细胞测序分析的新型生物科技服务企业。

公司总员工已达到百余人,其中95%以上具有学士学位,40%以上具有硕士及以上学位,专职科研人员20余人,专职销售人员30余人,覆盖全国90%的省市,核心成员来自国内知名高效、基因测序公司、信息分析公司等。

公司运营至今销售额累积1亿左右,成为国内成长最迅速的二代测序与生物科研服务企业之一。




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Small RNA-seq

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Small RNA-seq


产品介绍:

small RNA 是生物体内一类重要的功能分子,广泛存在于高等和低等生物体内。Small RNA 与细胞的发育、分化、疾病等密切相关。近年来的研究表明,small RNA 不仅可作为癌症诊断、识别、预后的标志物,也在癌症治疗中发挥作用。

small RNA包括microRNAncRNAsiRNAsnoRNApiRNA 等。它们的主要功能是诱导基因沉默,调控细胞生长、发育、基因转录和翻译等生物学过程。通过mRNA 降解、翻译抑制、异染色体形成以及DNA 去除等多种途径,广泛的参与调控生物体的生长发育和疾病发生。

基于新一代高通量测序技术的small RNA 测序,可一次性获得数百万条small RNA序列,能够快速地鉴定某种组织在特定状态下的所有已知small RNA 并发现新的small RNA,以及预测small RNA 的靶基因,为small RNA 功能研究和调控机制提供有力的工具。


技术流程:

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样本要求:

细胞:1×108 

动物组织:0.5 g

植物组织5 g

真核微生物:1 g

 

建库测序:

测序策略:SE50

测序深度:10-20 M clean reads

适用范围:有参考基因组物种


项目周期:

45个工作日


案例分享

《利用CRISPR敲除突变体对秀丽隐杆线虫lincRNAs进行系统评价》

Systematic evaluation of C. elegans lincRNAs with CRISPR knockout mutants.Genome Biology, 2019, 20:7.(IF=14.028)


研究背景:

长基因间RNA (lincRNAs)在真核细胞中起着关键作用,但对动物的lincRNAs表型缺乏系统的分析。


研究结果:

获得了170LincRNA并依据这些lincRNA获得了150个基因敲除秀丽隐杆线虫突变株,对这些突变株进行特征分析获得了23个突变株具有6个表型特征。一些秀丽隐杆线虫的lncRNA顺式调控其邻近基因的表达,而一些LincRNA则起反式调控作用来对抗microRNA。还研究了转录因子对lincRNA表达的调控,并分析了两个转录因子UNC-30UNC-55共同调控linc-73表达的途径。此外,linc-73具有顺式调控其邻近的肌动蛋白基因unc-104表达的功能,从而在秀丽隐杆线虫的运动中发挥作用。

图片53.png


图:LncRNAmiRNA的共表达调控网络




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