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样本处理及建库系统 / 二代测序系统
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武汉爱基百客生物科技有限公司（简称爱基百客），位于武汉高农生物园，办公面积逾3000平方米，是一家专注于表观组学、单细胞时空组学和高通量测序分析服务的新型生物科技企业。

公司旨在为客户提供专业的科研服务，运营至今合作的科研客户近千家，涵盖国内知名科研院所、高校以及相关生物企业，运营至今销售额超1亿元，科研成果曾多次在Science、Cancer Cell、Plant Cell、Nature Communications、J HEMATOL ONCOL等国际高水平学术期刊发表，受到了客户广泛好评，是国内成长最迅速的多组学科研服务企业之一。

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详细说明

Small RNA-seq

产品介绍
案例分享

Small RNA-seq

产品介绍：

smallRNA是生物体内⼀类重要的功能分子，广泛存在于高等和低等生物体内。SmallRNA与细胞的发育、分化、疾病等密切相关。近年来的研究表明，smallRNA不仅可作为癌症诊断、识别、预后的标志物，也在癌症治疗中发挥作用。

smallRNA包括microRNA、siRNA、snoRNA、piRNA等。它们的主要功能是诱导基因沉默，调控细胞生长、发育、基因转录和翻译等生物学过程。通过mRNA降解、翻译抑制、异染色体形成以及DNA去除等多种途径，广泛的参与调控⽣物体的生长发育和疾病发生。基于新⼀代⾼通量测序技术的smallRNA 测序，可⼀次性获得数百万条small RNA 序列，能够快速地鉴定某种组织在特定状态下的所有已知smallRNA并发现新的smallRNA，以及预测smallRNA靶基因，为smallRNA功能研究和调控机制提供有力的工具。

分析流程：

miRNA分析流程.png

样本要求：

细胞：≥1×10⁶个

动物组织：≥3 g

植物组织：≥1g

真核微生物：≥300mg/10⁶

建库测序：

测序策略：SE50

测序量：10-20 M

适用范围：有参考基因组物种

项目周期：

45个工作日

案例分享

【项⽬⽂章】《通过转录组、miRNA组及降解组联合分析探究桂花开放与衰老的miRNA-靶基因调控模块》

Exploring miRNA-target modules regulating flower opening and senescence in Osmanthus fragrans through integrated transcriptome, miRNAome, and degradome analysis

期刊：Industrial Crops & Products｜影响因⼦：6.2｜发表时间：2025年｜发表单位：湖北科技学院

研究背景：

桂花是中国十大传统名花之一，广泛应用于观赏、食品和化妆品行业。花朵开放和衰老过程对其生命周期至关重要，但其最佳商业采收期仅持续 2-3 天，这成为了产业发展的重大瓶颈。MicroRNA (miRNA) 是调节植物生长、发育和胁迫反应的关键非编码小 RNA (sRNA)。然而，关于miRNA与mRNA之间的调控网络，特别是在桂花花朵开放和衰老过程中的作用，目前仍知之甚少。

研究结果：

该研究通过Small RNA-seq 测序鉴定了135个miRNA，包括46个已知miRNA和89个新miRNA，其中73个表现出差异表达。此外，利用降解组测序鉴定了112个miRNA的529个靶基因，其中57个靶基因被归类为0-2类。在这些靶基因中，有26个是转录因子，包括12个SBP、5个NAC、3个ARF、2个AP2和2个GRF。针对所有这些靶基因对构建了一个调控网络。通过该网络以及对差异表达基因(DEG)的加权基因共表达网络分析(WGCNA)，研究鉴定了调节花朵开放 (ofr-miR156j-OfSPL2/SPL9和ofr-miR396a-5p-OfGRF1) 和花朵衰老 (ofr-miR164b-5p-OfNAC079和ofr-miR394b-5p-OfFBXO6) 的关键miRNA-mRNA模块。这些模块通过生物信息学分析和qRT-PCR 检测得到了进一步验证。该研究首次系统鉴定了参与桂花花朵开放和衰老的miRNA，建立了一个全面的调控网络，为未来深入研究miRNA介导的这些过程的调控机制奠定了基础。