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宏基因组测序
宏基因组测序 产品介绍: 宏基因组测序(Metagenome sequencing )是由Handelsman等在1998年提出的概念,其定义为“the genome of the total microbiota found in nature ”,即环境中所有微⽣物基因组的总和。宏基因组主要以环境样品中的微⽣物群体基因组为研究对象,以功能基因筛选和/或测序分析为研究⼿段,以微⽣物多样性、种群结果、进化关系、功能活性、互作关系及环境之间的关系为研究⽬的的新的微⽣物研究⽅法。 技术路线: 样本要求: 基因DNA样品量:≥ 3μg DNA浓度:≥20ng/μl DNA体积:≥15μl
建库测序: 测序策略:PE150 测序量:10G
项目周期: 45个工作日 案例分享 《⼟壤环境以及微⽣物组成促进⼴陈⽪活性成分单萜合成和积累》 Soilconditionsandtheplantmicrobiomeboosttheaccumulationofmonoterpenes inthefruitofCitrusreticulata‘Chachi’ 期刊:Microbiome|影响因⼦:16.8|发表时间:2023|发表单位:华南农业⼤学与华⼤⽣命科学研究院 研究背景: 陈⽪药材分为“陈⽪”和“⼴陈⽪”。⼴陈⽪特指种植于⼴东新会地区的芸⾹科柑橘属茶枝柑(Citrus reticulate‘Chachi’)果实的果⽪,⼴陈⽪是⼴东省⾸批⽴法保护的⼋⼤岭南中药之⼀ 。⻩酮类和萜烯类化合物是⼴陈⽪中重要的两⼤类功效成分,在⼴陈⽪的品质评定和临 床疗效中起着重要作⽤。药⽤植物功效成分合成是从物种遗传调控,到产地⽓候、⼟壤养分、 根系微⽣物等多维度互作的⼀个系统过程,但对其道地性形成的⽣物学机制研究依然不够充分。在遗传背景相同的情况下,⼟壤营养、根系微⽣物组如何影响植物药⽤成分合成和积累的⽣物学机制还知之甚少。 研究结果: 使⽤多组学⽅法,能够确定导致道地产区⼴陈⽪中单萜烯浓度增加的因素。根际⼟壤和内⽣微⽣物共同促进了单萜的积累。合成群落实验证实来⾃根际⼟壤中的链霉菌Strep-4能够通过诱导植物的系统性抗性来促进茶枝柑活性成分单萜的合成和积累。该研究清楚地说明了⼟壤性质和⼟壤微⽣物对道地产区柑橘果⽪单萜产量的影响。研究结果为农业实践中通过配⽅施 肥和精确的微⽣物群管理,依靠⽣物活性成分来改善果实质量提供了基础依据。 图:核⼼和⾮核⼼根际⼟壤微⽣物群之间差异细菌的功能特征 |