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宏基因组测序
宏基因组测序 产品介绍： 宏基因组测序（Metagenome sequencing ）是由Handelsman等在1998年提出的概念，其定义为“the genome of the total microbiota found in nature ”，即环境中所有微⽣物基因组的总和。宏基因组主要以环境样品中的微⽣物群体基因组为研究对象，以功能基因筛选和/或测序分析为研究⼿段，以微⽣物多样性、种群结果、进化关系、功能活性、互作关系及环境之间的关系为研究⽬的的新的微⽣物研究⽅法。 技术路线：
样本要求： 基因DNA样品量：≥ 3μg DNA浓度：≥20ng/μl DNA体积：≥15μl
建库测序： 测序策略：PE150 测序量：10G
项目周期： 45个工作日 案例分享 【项目文章】《综合性肺部微生物基因与基因组目录助力引发猪肺部病变的猪肺炎支原体菌株机制研究》 Comprehensive lung microbial gene and genome catalogs assist the mechanism survey of Mesomycoplasma hyopneumoniae strains causing pig lung lesions 期刊：iMeta｜影响因⼦：33.2｜发表时间：2024｜发表单位：江西农业大学 研究背景： 了解下呼吸道微生物组的群落结构对于阐明其在呼吸道疾病中的作用至关重要。然而，由于难以从健康个体和患病个体中获取微生物样本，相关研究目前仍然较少。 研究结果： 本研究构建首个猪肺部微生物宏基因组参考目录，涵盖噬肉支原体（M. hyopneumoniae）全基因组多样性。宏基因组测序分析揭示不同致病力菌株在碳水化合物代谢、细胞黏附及免疫逃逸相关基因簇的显著差异。通过比较基因组学，鉴定出高致病株特有的毒力岛和相变异基因，阐明其通过表面抗原变异躲避宿主清除的机制。整合转录组数据构建菌株-宿主互作网络，发现特定菌株刺激促炎因子风暴的关键效应分子。研究为猪呼吸道疾病精准防控提供了分子流行病学依据和新型疫苗靶点。
图：构建猪下呼吸道微生物组的宏基因组组装基因组（MAGs） |
