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武汉爱基百客生物科技有限公司(简称爱基百客),注册于2014年12月31日,次年10月正式开始对外运营,是一家专业提供表观组学技术服务、高通量测序、单细胞测序分析的新型生物科技服务企业。

公司总员工已达到百余人,其中95%以上具有学士学位,40%以上具有硕士及以上学位,专职科研人员20余人,专职销售人员30余人,覆盖全国90%的省市,核心成员来自国内知名高效、基因测序公司、信息分析公司等。

公司运营至今销售额累积1亿左右,成为国内成长最迅速的二代测序与生物科研服务企业之一。




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TECHNOLOGY SERVICE

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详细说明

ATAC-seq

  • 产品介绍
  • 案例分析

ATAC-seq(Assay for Transposase-Accessible Chromatin with highthroughput sequencing)


产品介绍:

ATAC-Seq是一种用于探究染色质开放区域的技术,该技术利用Tn5转座酶获得开放的染色质区段open chromatin),通过高通量测序及生物信息学分析来挖掘相关基因及调控信息,以此探究生物学相关问题。ATAC-seqBuenrostro2013年首次提出,作为MNase-seqFAIRE-seqDNAse-seq的替代或补充方法,实验周期更快,应用更广泛。

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ATAC-seq技术原理示意图


技术路线:

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样本要求:

细胞:5×104 

动物组织:1 g 

植物组织1 g

真核微生物:协商


建库测序:

测序策略:Illumina Hiseq, PE150

测序深度:100 M clean reads


项目周期:

90个工作日


案例分析

《哺乳动物早期胚胎的染色质可接近性景观》

The landscape of accessible chromatin in mammalian preimplantation embryos (Nature, IF: 43.133 )


研究背景:

在哺乳动物中,广泛的染色质重组对于胚胎着床前发育过程中最终结合的配子重编程至全能状态至关重要。然而,全球染色质景观及其动态在这一时期仍然没有探索。


研究结果:

研究人员选择胚胎发育的2-cell4-cell8-cell以及Blastocyst等时期利用ATAC-seqRNA-seq发现了哺乳动物早期发育过程中染色体动态变化的特征以及可能的调控元件和转录因子,还揭示了在这个过程中染色质和转录调控元件不同于体细胞的特殊作用模式。

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图:在小鼠胚胎细胞开放染色质景观



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