单细胞转录组10xGenomics

案例分享

【项⽬⽂章】《胶质⺟细胞瘤恶性细胞与⾎管细胞谱系关系的解析》

Resolving
the
lineage
relationship
between
malignant
cells
and
vascular
cells
in
aglioblastomas

期刊：Protein
&
Cell
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影响因⼦：15.328
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发表时间：2022年
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发表单位：武汉⼤学中南医院

研究背景：

多形胶质⺟细胞瘤(Glioblastoma  multiform, GBM)是⼀种⾼度恶性、异质性的脑肿瘤，包含多种类型的肿瘤和⾮肿瘤细胞。GBM细胞是否可以转分化为⾮神经细胞类型，包括壁细胞或内⽪细胞，以⽀持肿瘤⽣⻓和侵袭仍存在争议。破译GBM微环境的细胞组成和谱系历史，包括内⽪细胞、壁细胞和肿瘤相关的⼩胶质细胞和巨噬细胞，对开发GBM的靶向治疗具有重要意义。GBM细胞被认为起源于突变的神经⼲细胞/祖细胞。先前的研究表明，GBM⼲细胞可能产⽣⾎管内⽪细胞(ECs)或壁细胞⽀持肿瘤⽣⻓和侵袭。作者早期的研究还发现，⼲细胞标志物既可以标记胶质瘤⼲细胞样细胞，也可以标记壁细胞，提⽰胶质⺟细胞瘤细胞可能存在跨谱系的转分化。最新的单细胞技术结合谱系追踪分析，对理解在发育过程、组织稳态、再⽣和 病理条件下的细胞成分、细胞状态和命运分化有深刻的意义。

研究内容：

该研究在⼩⿏中⽣成了2个遗传GBM模型，模拟⼈类GBM的基础病理和分⼦特征。作者对谱系进⾏了追踪，并利⽤单细胞RNA-seq对拷⻉数变异进⾏了分析。该研究促进了对GBM细胞谱系潜⼒的理解，并可能为GBM患者的靶向治疗提供⻅解。

图：NPC^TKD GBM样本中⾎管细胞和恶性细胞的CNV模式和分布