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武汉爱基百客生物科技有限公司(简称爱基百客),位于武汉高农生物园,办公面积逾3000m2,是一家专业提供单细胞与空间组学测序分析、表观组学科研服务和高通量测序分析的新型生物科技服务企业。

公司旨在为客户提供最专业的科研服务,运营至今合作的科研客户近千家,涵盖国内知名科研院所、高校以及相关生物企业,运营至今销售额超1亿元,科研成果曾多次在Cancer Cell、Plant Cell、Nature Communications、J HEMATOL ONCOL等国际高水平学术期刊发表,受到了客户广泛好评,是国内成长最迅速的高通量测序科研服务企业之一。

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全长转录组测序

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全长转录组测序


产品介绍:

Isoform定量转录组测序即Isoform定量全⻓转录组测序,基于Nanopore、Pacbio三代测序平台,⽆需打断直接对cDNA进⾏测序,获得⾼质量的全⻓转录本序列。可准确识别可变剪接、基因融合、可选择性多聚腺苷酸化(APA)和等位基因,并对异构体进⾏准确定量。


分析流程:

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样本要求:

RNA总量及浓度:浓度≥200ng /μL,总量⼤于10μg; 

RNA纯度:OD260/OD280=2.0-2.2,OD260/OD2302.0

                    RNA样品澄清透明,⽆不溶物,RIN值≥8,完整性良好,⽆降解,28S18S清晰。


技术参数:

仪器平台:Nanopore、Pacbio

测序量:≥10G


项目周期:

45个⼯作⽇


案例分享


《通过lncFAM介导的HNRNPL向MYBPC2启动⼦的募集增强肌肉生成》

EnhancedmyogenesisthroughlncFAM-mediatedrecruitmentofHNRNPLtotheMYBPC2promoter

期刊:NucleicAcidsResearch|影响因⼦:19.160|发表时间:2022年|发表单位:马里兰⼤学


研究背景:

哺乳动物转录组包括⼀个庞大的长链非编码(lnc)RNA家族,这些RNA与肌⽣成等⽣理过程相关,肌肉在胚胎发育期间形成,并在成年期再生。然而,lncRNA调控人类肌生成的具体分子机制尚不清楚。


研究结果:

在本研究中,作者鉴定了⼀种新的肌肉特异性lncRNA:lncFAM71E1-2:2(lncFAM),其在早期⼈类肌生成过程中显著增加,结合纳米孔RNA测序对其进行更加准确的注释。lncFAM的过表达促进了人成肌细胞向肌管分化,而沉默lncFAM则抑制了这⼀过程。由于lncFAM存在于细胞核中,通过质谱法(ChIRP MSRNA纯化分离染⾊质,以确定其促进肌细胞⽣成的分子机制 。对lncFAM相互作用蛋白的分析表明,lncFAM将RNA结合蛋白HNRNPL募集到MYBPC2启动⼦,进而增加MYBPC2 mRNA转录并增强肌源蛋白MYBPC2的产生。这些结果突出了⼀种新的核糖核蛋白复合物lncFAM-HNRNPL转录上调MYBPC2表达以促进肌生成机制。

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图:肌生成过程中人成肌细胞的lncFAM

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