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武汉爱基百客生物科技有限公司(简称爱基百客),位于武汉高农生物园,办公面积逾3000平方米,是一家专注于表观组学、单细胞时空组学和高通量测序分析服务的新型生物科技企业。


公司旨在为客户提供专业的科研服务,运营至今合作的科研客户近千家,涵盖国内知名科研院所、高校以及相关生物企业,运营至今销售额超1亿元,科研成果曾多次在Science、Cancer Cell、Plant Cell、Nature Communications、J HEMATOL ONCOL等国际高水平学术期刊发表,受到了客户广泛好评,是国内成长最迅速的多组学科研服务企业之一。

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TECHNOLOGY SERVICE

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详细说明

MeRIP-seq

  • 产品介绍
  • 案例分析

MeRIP-seq(Methylated RNA immunoprecipitation sequencing)


产品介绍:

MeRIP-seq 原理是通过m6A特异性抗体对细胞内具有m6A 修饰的RNA片段进行免疫共沉淀,将富集下来的RNA片段进行高通量测序。结合生物信息学分析,即可在转录组范围内对m6A修饰进行系统研究

m6AN6-methyladenosine6-甲基腺嘌呤)是真核生物mRNA内部序列中十分常见的一种甲基化修饰,同时可以功能性的调节真核生物的转录组从而影响mRNA的剪接、出核、定位、翻译和稳定。m6A RNA出现在多种重要的细胞生命过程中,意味着mRNA甲基化参与了多种生物学过程,如干细胞分化、生物节律等,同时也参与了多种疾病的发生,包括肿瘤、肥胖和不育等。

MeRIP-seq  建库流程.png

图:MeRIP-seq建库测序流程示意图


分析流程:

image.png


样本要求:

细胞:1×10

动物组织:3g

植物组织:3g

真核微生物:2g


建库测序:

测序策略:Illumina, PE150

测序深度:20-30M clean reads


项目周期:

60个工作日


案例分析

【项目文章】《康乃馨(Dianthus caryophyllus L.)中动态m6A RNA甲基化与乙烯诱导的花瓣衰老相关,并可能调节抗氧化和代谢途径

Dynamic m6A RNA methylation correlates with ethylene-induced petal senescence and may modulate antioxidant and metabolic pathways in carnation (Dianthus caryophyllus L.)

期刊:The Plant Journal|影响因⼦:5.7|发表时间:2025年|发表单位:华中农业大学

研究背景:

花衰老是植物生命周期中的关键阶段,受乙烯等多种激素调控。尽管N6-甲基腺苷(m6A)RNA修饰在植物发育和逆境响应中具有重要作用,但其在乙烯诱导的花衰老中的功能尚不明确。康乃馨(Dianthus caryophyllus L.)作为乙烯敏感型切花,是研究花衰老的理想模型。本研究旨在探讨m6A修饰在乙烯信号下如何动态变化,并解析其通过抗氧化和代谢途径影响康乃馨花衰老的分子机制。

研究结果:

  在这项研究中,液相色谱-串联质谱(LC-MS/MS)分析表明,乙烯处理显著降低了康乃馨(Dianthus caryophyllus L.)花瓣中的m6A水平。MeRIP-seq分析进一步显示,乙烯处理导致了m6A修饰分布模式的改变,特别是终止密码子区域附近的富集度有所增加。进一步的研究鉴定了四个与衰老相关的基因,包括抗氧化基因(DcGST10和DcGPX8)和三羧酸(TCA)循环基因(DcACLA和DcACLB)。这些基因的m6A水平与其mRNA表达水平呈正相关。此外,我们发现沉默这些基因会显著加速康乃馨花瓣的衰老并增加氧化应激,这突显了m6A修饰在调节抗氧化和代谢途径中的关键作用。本研究证实了康乃馨花瓣衰老过程中m6A修饰的动态变化及其潜在机制,为植物衰老过程中的表观遗传调控网络提供了新的见解。


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图:乙烯处理康乃馨花过程中m⁶A的动态分布







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