标题

科研服务实验室

符合国家IS0 9001标准，实验操作流程实行内部管理标准化、可追溯。
样本处理及建库系统

样本处理及建库系统 / 二代测序系统
二代测序系统

二代测序系统

首页

加入我们

关于我们

武汉爱基百客生物科技有限公司（简称爱基百客），位于武汉高农生物园，办公面积逾3000平方米，是一家专注于表观组学、单细胞时空组学和高通量测序分析服务的新型生物科技企业。

公司旨在为客户提供专业的科研服务，运营至今合作的科研客户近千家，涵盖国内知名科研院所、高校以及相关生物企业，运营至今销售额超1亿元，科研成果曾多次在Science、Cancer Cell、Plant Cell、Nature Communications、J HEMATOL ONCOL等国际高水平学术期刊发表，受到了客户广泛好评，是国内成长最迅速的多组学科研服务企业之一。

加入我们

核酸蛋白互作组学

基因组相关研究

多组学

核酸甲基化修饰

染色质图谱

转录调控相关研究

单细胞时空组学

综合项目服务

三代测序

网站首页

TECHNOLOGY SERVICE

科技服务

网站首页 >> 科技服务 >>基因组相关研究 >> ddRAD-seq

详细说明

ddRAD-seq

产品介绍
案例分享

ddRAD-seq（Double Digest Restriction-site associated DNA sequencing）

产品介绍：

简化基因组测序是指利用限制性内切酶打断基因组DNA，对特定片段进行高通量测序获得海量遗传多态性标签序列来充分代表目标物种全基因组信息的测序策略。ddRAD-seq（Restriction-site associated DNA sequencing）技术是在二代测序基础上发展起来的一项基于全基因组酶切位点的简化基因组测序技术。该方法技术流程简单，不受有无参考基因组的限制，可大大简化基因组的复杂性，减少实验费用，通过一次测序就可以获得数以万计的多态性标记。

图：ddRAD-seq实验流程

技术流程：

样本要求：

DNA样品量≥ 3μg，OD260/280:1.8-2.0

建库测序：

测序策略：Illumina Hiseq, PE150

测序深度：至少1×（组装样本至少5×）

项目周期：

33个工作日

案例分享

【项目文章】《基于ddRAD测序的油茶杂交群体遗传变异及与果实性状的关联分析》

Genetic Variation in a Crossing Population of Camellia oleifera Based on ddRAD Sequencing and Analysis of Association with Fruit Traits

期刊：Curr Issues Mol Biol | 影响因子：3.0 | 发表时间：2025 | 发表单位：福建农林大学

研究背景：

茶油是一种源自木本植物的重要优质食用油。在中国，油茶（Camellia oleifera）是山茶属中种植面积最大、分布最广的油料植物，其种子是获取茶油的最主要来源。在当前的研究中，提高茶油的产量和品质是油茶遗传育种的主要目标。本研究旨在调查一个油茶早期杂交群体的遗传变异程度，并鉴定与果实性状显著相关的单核苷酸多态性（SNP）及基因，从而为未来的性状改良提供分子标记辅助选择和基因编辑的基础。

研究结果：

该研究选择了一个树龄约40年的油茶杂交群体，共计330个样本。随后，利用ddRAD测序技术进行了SNP检测和群体遗传分析，并对连续两年重复测定的果实性状进行了关联分析。研究结果表明，鉴定出的高质量SNP超过800万个，但绝大多数SNP位于基因间区。该群体的核苷酸多态性处于较低水平，且Tajima's D值大多大于0，表明该群体的变异不符合中心进化模型。群体结构分析显示，该群体有7个理论上的遗传物质来源，可分为7个类群，聚类分析结果也支持了群体结构分析的结论。关联分析鉴定出了与单果种子数和种仁含油率基因相关的显著SNP。该研究的发现为栽培油茶的分子育种和未来的遗传改良提供了依据。