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武汉爱基百客生物科技有限公司(简称爱基百客),位于武汉高农生物园,办公面积逾3000m2,是一家专业提供单细胞与空间组学测序分析、表观组学科研服务和高通量测序分析的新型生物科技服务企业。

公司旨在为客户提供最专业的科研服务,运营至今合作的科研客户近千家,涵盖国内知名科研院所、高校以及相关生物企业,运营至今销售额超1亿元,科研成果曾多次在Cancer Cell、Plant Cell、Nature Communications、J HEMATOL ONCOL等国际高水平学术期刊发表,受到了客户广泛好评,是国内成长最迅速的高通量测序科研服务企业之一。

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详细说明

MeDIP-seq

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  • 案例分析

MeDIP-seq(Methylated DNA Immunoprecipitation Sequencing)


产品介绍

MeDIP-Seq (甲基化DNA免疫共沉淀测序)是一种基于富集方法研究DNA甲基化的测序技术,针对不同甲基化类型选择不同抗体。目前,主要是利用5mC/5hmC抗体特异性富集基因组上发生甲基化的DNA片段,在高CpG密度、高DNA甲基化水平区域具有很好的抗体亲和性,然后通过高通量测序可以在全基因组水平上进行高精度的CpG密度的高甲基化区域研究。利用MeDIP-seq技术能快速地寻找基因组上的甲基化区域,从而比较不同细胞、组织或疾病样本间的DNA甲基化修饰模式的差异,为生物学研究或临床应用方案提供理论依据。

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图:MeDIP-seq建库测序过程


技术路线:

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样本要求:

细胞:≥1×10 7

物组织:3g

植物组织:3g

真核微生物:≥500mg


建库测序:

测序策略:NovaSeq6000, PE150

测序深度:20-30M clean reads


项目周期:

45个工作日


案例分析

【项⽬⽂章】《hMeDIP-Seq鉴定出INPP4A是嗜酸性的慢性⿐窦炎伴⿐息⾁的⼀种新的⽣物标志物》

ThehMeDIP-SeqidentifiedINPP4Aasanovelbiomarkerforeosinophilicchronicrhinosinusitiswithnasalpolyps

期刊:Epigenomics|影响因⼦:4.357|发表时间:2022年|发表单位:武汉⼤学⼈⺠医院


研究背景:

慢性⿐窦炎伴⿐息⾁(CRSwNP)是⼀种多因素、异质性和社会经济负担沉重的⿐腔和⿐窦炎症性疾病。嗜酸性CRSwNP (ECRSwNP) 和⾮嗜酸性CRSwNP (NECRSwNP) CRSwNP的两种内分型,它们具有不同的免疫病理模式,并通过嗜酸性粒细胞浸润的程度来区分。嗜酸性慢性⿐-⿐窦炎伴⿐息⾁( ECRSwNP)是慢性⿐-⿐窦炎伴⿐息⾁的⼀种内型,其症状更严重,与哮喘的相关性更强,复发⻛险更⼤。⽬前尚不清楚DNA羟甲基化是否会影响ECRSwNP


研究结果:

该研究利⽤MeDIP-seq5hmc抗体)技术分析了嗜酸性慢性⿐窦炎伴⿐息⾁、⾮嗜酸性慢性⿐窦炎伴⿐息⾁和对照组,嗜酸性慢性⿐窦炎伴⿐息⾁和⾮嗜酸性慢性⿐窦炎伴⿐息⾁之间找到了26个基因表现出差异的DNA羟甲基化。最后,研究发现INPP4A是嗜酸性慢性⿐窦炎⿐息⾁的⽣物标记物。

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图:嗜酸性和⾮嗜酸性慢性⿐窦炎伴⿐息⾁的DNA羟甲基化反应的⽐较



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