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样本处理及建库系统 / 二代测序系统
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武汉爱基百客生物科技有限公司（简称爱基百客），位于武汉高农生物园，办公面积逾3000平方米，是一家专业提供单细胞与空间组学测序分析、表观组学科研服务和高通量测序分析的新型生物科技服务企业。

公司旨在为客户提供最专业的科研服务，运营至今合作的科研客户近千家，涵盖国内知名科研院所、高校以及相关生物企业，运营至今销售额超1亿元，科研成果曾多次在Science、Cancer Cell、Plant Cell、Nature Communications、J HEMATOL ONCOL等国际高水平学术期刊发表，受到了客户广泛好评，是国内成长最迅速的高通量测序科研服务企业之一。

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网站首页 >> 科技服务 >>核酸蛋白互作组学 >> ChIP-seq

详细说明

ChIP-seq

产品介绍
案例分享

ChIP-seq（Chromatin Immunoprecipitation with highthroughput sequencing ）

产品介绍：

染⾊质免疫共沉淀技术( Chromatin Immunoprecipitation, ChIP )是⼀种适用于研究蛋白质与生物体细胞中DNA相互作用的经典方法，将ChIP与第⼆代测序技术相结合的ChIP-seq技术，能够高效地在全基因组范围内检测与组蛋白、转录因⼦等互作的DNA 区段，研究体内转录因子和靶基因直接相互作用的方法，对于调控蛋白在基因组上的结合靶点筛选、差异化表观遗传变异的原理揭示提供了重要的解决思路。

chip -seq.png

分析流程：

CHIP分析流程图.png

技术优势：

项⽬经验丰富，研究物种200+种，累计实验2000余次。
提供前期实验设计、测序、分析以及后期验证（ChIP-qPCR、EMSA)⼀站式服务。
强大的生信团队，满⾜客⼾各种数据挖掘及分析需求。
项目文章多次发表于Cancer Cell、Nature Plants、 Nature Metabolism以及Plant Cell等期刊。

项目经验：

CHIP项目经验.png

样本要求：

细胞：≥5✖10⁶个

动物组织：≥1 g

植物组织：≥5 g

真核微生物：500 mg

建库测序：

测序策略：NovaSeq6000,PE150

测序深度：6-12 G

项目周期：

60个工作日

案例分析

【项⽬⽂章】《CAR-T细胞中BATF的消耗通过诱导对衰竭和中央记忆细胞形成的抵抗来增强抗肿瘤活性》

DepletionofBATFinCAR-Tcellsenhancesantitumoractivity

byinducingresistanceagainst exhaustionandformationofcentralmemorycells

期刊：CancerCell｜影响因⼦：38.585｜发表时间：2022年｜发表单位：中国科学院动物研究所

研究背景：

嵌合抗原受体（CAR）T细胞治疗⾎液癌在临床应⽤中已显⽰出令⼈印象深刻的疗效，但其对实体肿瘤的疗效有限，其中⼀个主要的挑战是T细胞衰竭。为了解决这⼀挑战，该研究使⽤功能低下的CAR-T 细胞模型进⾏了候选基因筛选，发现碱性亮氨酸拉链ATF样转录因⼦（BATF）的消耗改善了CAR-T 细胞的抗肿瘤性能。

研究结果：

通过控制 CAR-T 细胞与肿瘤细胞的共培养条件，在体外获得具有典型耗竭特征的⼈原代CAR-T 细胞耗竭模型。为了发现新的T细胞耗竭调控因⼦，该研究基于这⼀模型进⾏了候选基因的筛选，发现敲除转录因⼦BATF 可以显著提⾼CAR-T细胞的体内、外抗肿瘤活性。在6种不同CAR-T 细胞及⼩⿏ OT-1T 细胞中，BATF缺失均能提⾼T细胞的抗肿瘤能⼒。后续的机制研究中利⽤ChIP-seq和RNA-seq 技术发现 BATF直接靶向结合耗竭相关的多个关键基因并上调其表达，同时 BATF 靶向并调控效应及记忆T细胞相关基因的表达。因此，敲除BATF在提⾼CAR-T细胞抵抗耗竭能⼒的同时使得CAR-T细胞产⽣更多的中央记忆细胞亚群，进⽽提⾼了 CAR-T 细胞治疗实体瘤的效果。