案例分析
《跨越20个哺乳动物物种的增强子进化》
Enhancer Evolution across 20 Mammalian Species. Cell, 2015, 160(3):554-566. (IF: 30.410 )
研究背景:
哺乳动物的辐射与基因组非编码区域的快速变化相对应,但我们对哺乳动物的调控进化缺乏全面的认识。
研究结果:
研究人员通过分析H3K27Ac和H3K4me3的基因组富集,追踪了来自20种哺乳动物肝脏中六种不同顺序的活跃的启动子和增强子的进化。发现增强子的快速进化是哺乳动物基因组的一个普遍特征。大多数最近进化的增强子来自祖先DNA的适应,而不是谱系特异性重复元件的扩展。相反,几乎所有的肝脏启动子在这些物种中都是部分或完全保守的。进一步发现,最近进化的增强子可以与正调控下的基因相关联,表明这种方法用于注释基因组序列中调节适应性的能力。这些结果提供了对哺乳动物调控进化的功能遗传学的重要见解。

图:20种哺乳动物的肝脏体内调节活性的评估