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样本处理及建库系统 / 二代测序系统
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武汉爱基百客生物科技有限公司（简称爱基百客），位于武汉高农生物园，办公面积逾3000m2，是一家专业提供单细胞与空间组学测序分析、表观组学科研服务和高通量测序分析的新型生物科技服务企业。

公司旨在为客户提供最专业的科研服务，运营至今合作的科研客户近千家，涵盖国内知名科研院所、高校以及相关生物企业，运营至今销售额超1亿元，科研成果曾多次在Cancer Cell、Plant Cell、Nature Communications、J HEMATOL ONCOL等国际高水平学术期刊发表，受到了客户广泛好评，是国内成长最迅速的高通量测序科研服务企业之一。

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网站首页 >> 科技服务 >>染色质图谱 >> ChIP-seq

详细说明

ChIP-seq

产品介绍
案例分享

ChIP-seq（Chromatin Immunoprecipitation with highthroughput sequencing ）

产品介绍：

将染色质免疫共沉淀与第二代测序技术相结合的ChIP-Seq技术，能够高效地在全基因组范围内检测与组蛋白、转录因子等互作的DNA区段。首先通过染色质免疫共沉淀技术（ChIP）特异性地富集目的蛋白结合的DNA片段，并对其进行纯化与文库构建；然后对富集得到的DNA片段进行高通量测序。研究人员通过将获得的数百万条序列标签精确定位到基因组上，从而获得全基因组范围内与组蛋白、转录因子等互作的DNA区段信息。

chip -seq.png

技术路线：

样本要求：

细胞：＞5×10⁷个

动物组织：≥1 g

植物组织：≥5 g

真核微生物：500 mg

建库测序：

测序策略：Illumina Hiseq, PE150

测序深度：6-12 G

项目周期：

90个工作日

案例分析

《跨越20个哺乳动物物种的增强子进化》

Enhancer Evolution across 20 Mammalian Species. Cell, 2015, 160(3):554-566. (IF: 30.410 )

研究背景：

哺乳动物的辐射与基因组非编码区域的快速变化相对应，但我们对哺乳动物的调控进化缺乏全面的认识。

研究结果：

研究人员通过分析H3K27Ac和H3K4me3的基因组富集，追踪了来自20种哺乳动物肝脏中六种不同顺序的活跃的启动子和增强子的进化。发现增强子的快速进化是哺乳动物基因组的一个普遍特征。大多数最近进化的增强子来自祖先DNA的适应，而不是谱系特异性重复元件的扩展。相反，几乎所有的肝脏启动子在这些物种中都是部分或完全保守的。进一步发现，最近进化的增强子可以与正调控下的基因相关联，表明这种方法用于注释基因组序列中调节适应性的能力。这些结果提供了对哺乳动物调控进化的功能遗传学的重要见解。

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