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科研服务实验室

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样本处理及建库系统 / 二代测序系统
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武汉爱基百客生物科技有限公司（简称爱基百客），位于武汉高农生物园，办公面积逾3000平方米，是一家专注于表观组学、单细胞时空组学和高通量测序分析服务的新型生物科技企业。

公司旨在为客户提供专业的科研服务，运营至今合作的科研客户近千家，涵盖国内知名科研院所、高校以及相关生物企业，运营至今销售额超1亿元，科研成果曾多次在Science、Cancer Cell、Plant Cell、Nature Communications、J HEMATOL ONCOL等国际高水平学术期刊发表，受到了客户广泛好评，是国内成长最迅速的多组学科研服务企业之一。

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网站首页 >> 科技服务 >>核酸蛋白互作组学 >> ChIP-seq

详细说明

ChIP-seq

产品介绍
案例分享

ChIP-seq（Chromatin Immunoprecipitation with highthroughput sequencing ）

产品介绍：

染⾊质免疫共沉淀技术( Chromatin Immunoprecipitation, ChIP )是⼀种适用于研究蛋白质与生物体细胞中DNA相互作用的经典方法，将ChIP与第⼆代测序技术相结合的ChIP-seq技术，能够高效地在全基因组范围内检测与组蛋白、转录因⼦等互作的DNA 区段，研究体内转录因子和靶基因直接相互作用的方法，对于调控蛋白在基因组上的结合靶点筛选、差异化表观遗传变异的原理揭示提供了重要的解决思路。

chip -seq.png

分析流程：

CHIP分析流程图.png

技术优势：

项⽬经验丰富，研究物种300+种，累计实验3000余次。
提供前期实验设计、测序、分析以及后期验证（ChIP-qPCR、Luc)⼀站式服务。
强大的生信团队，满⾜客⼾各种数据挖掘及分析需求。
项目文章多次发表于Science、Cancer Cell、Nature Plants、 Nature Metabolism以及Plant Cell等期刊。

项目经验：

CHIP项目经验.png

样本要求：

细胞：≥5✖10⁶个

动物组织：≥1 g

植物组织：≥5 g

真核微生物：500 mg

建库测序：

测序策略：NovaSeq6000,PE150

测序深度：6-12 G

项目周期：

60个工作日

案例分析

【项⽬⽂章】通过组织特异性油菜素甾醇抑制提⾼⽔稻穗分枝和产量

Enhancing rice panicle branching and grain yield through tissue-specific brassinosteroid inhibition

期刊：Science ｜影响因⼦：44.8｜发表时间：2024年｜发表单位：中国农业科学院作物科学研究所

研究背景：

作物育种本质上是在平衡各种特征以实现植物最佳表现的艺术。然而，由于特征之间复杂的关系，实现最佳平衡具有挑战性。一个主要障碍是各种特征之间的权衡，比如谷粒大小和数量之间的权衡。植物甾醇（BRs）是一类类固醇激素，促进谷粒大小并已被证明可以增强作物产量。尽管它们具有潜力，但BRs的多效性影响阻碍了它们在作物改良中的应用，并且它们在调节谷粒数量方面的作用仍不清楚。

研究结果：

该研究报道了复粒稻多粒簇形成的机制，揭示了BRs在通过精确的分生组织过渡来协调穗分枝和粒数方面的开创性作用。其中，研究找到BR分解代谢基因油菜素内酯缺乏的DWARF3（BRD3），还发现了一种支持这一功能的组织特异性BR通路，涉及BR信号抑制剂激酶GSK2，它可以磷酸化并稳定转录因子OsMADS1。随后，研究利用ChIP-seq和RNA-seq找到了OsMADS1的下游靶基因RCN2；进而确定了组织特异性的BR通路（BRD3-BR-GSK2-OsMADS1-RCN2）。