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武汉爱基百客生物科技有限公司(简称爱基百客),位于武汉高农生物园,办公面积逾3000m2,是一家专业提供单细胞与空间组学测序分析、表观组学科研服务和高通量测序分析的新型生物科技服务企业。

公司旨在为客户提供最专业的科研服务,运营至今合作的科研客户近千家,涵盖国内知名科研院所、高校以及相关生物企业,运营至今销售额超1亿元,科研成果曾多次在Cancer Cell、Plant Cell、Nature Communications、J HEMATOL ONCOL等国际高水平学术期刊发表,受到了客户广泛好评,是国内成长最迅速的高通量测序科研服务企业之一。

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网站首页 >> 科技服务 >>核酸的甲基化修饰 >>DNA甲基化 >> 靶向甲基化测序(TBS)
详细说明

靶向甲基化测序(TBS)

  • 产品介绍
  • 案例分享

TBS(Target Bisulfite sequencing)


产品介绍:

TBS是将传统的BSP(bisulfite sequencing PCR)与高通量测序技术结合起来。其原理为用重亚硫酸盐处理基因组DNA,所有未发生甲基化的胞嘧啶(C)被转化为尿嘧啶(U)而甲基化的胞嘧啶则不变。通过设计BSP引物扩增目的片段,此时尿嘧啶(U)全部转化为胸腺嘧啶(T),最后连接⼆代测序接头进⾏高通量测序,利用数据分析就能判断CpG位点是否发生甲基化。TBS技术可满足几个到几百个基因或位点的验证需求,具有高准确率、⾼通量、低成本、周期短等优势。


技术路线:

image.png


样本要求:

细胞:≥5×106

动物:10mg

基因组DNA3μg

DNA浓度:50ng/μl


建库测序:

测序策略:NovaSeq6000 

测序深度:≥200X


项目周期:

35个⼯作⽇





案例分享

《基因组学和表观基因组学图谱识别肺肠型腺癌和肺转移性结直肠癌》

Genomicandepigenomicprofilesdistinguishpulmonaryentericadenocarcinomafromlung metastaticcolorectalcancer

期刊:EBioMedicine|影响因⼦:11.205|发表时间:2022年|发表单位:国家癌症中⼼/中国医学科学院&武汉⼤学⼈⺠医院


研究背景:

肺肠腺癌(PEAC)作为肺腺癌的⼀种罕⻅亚型,由于与肺转移性结直肠癌(lmCRC)的形态学 谱重叠,其诊断仍然具有挑战性。然⽽,PEAC作为⼀种单独的肺癌实体的分⼦特征尚不清楚。


研究结果:

作者对32PEAC30lmCRC病患样本进⾏了全外显⼦组测序和靶向亚硫酸氢盐测序(TBS),探索了PEAC的全⾯基因组和表观基因组图谱,并确定了PEAC中的特征分⼦事件。基于PEAClmCRCDNA甲基化谱,作者还构建了⼀个分类器来区分这两种疾病,这在多中⼼外部验证队列中得到了很好的证实。

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图:基于甲基化分析的PEAClmCRC的分类


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