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武汉爱基百客生物科技有限公司（简称爱基百客），位于武汉高农生物园，办公面积逾3000平方米，是一家专注于表观组学、单细胞时空组学和高通量测序分析服务的新型生物科技企业。

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网站首页 >> 科技服务 >>核酸的甲基化修饰 >>DNA甲基化 >> 靶向甲基化测序（TBS）

详细说明

靶向甲基化测序（TBS）

产品介绍
案例分享

TBS（Target Bisulfite sequencing）

产品介绍：

TBS是将传统的BSP（bisulfite sequencing PCR）与高通量测序技术结合起来。其原理为用重亚硫酸盐处理基因组DNA，所有未发生甲基化的胞嘧啶（C）被转化为尿嘧啶（U）而甲基化的胞嘧啶则不变。通过设计BSP引物扩增目的片段，此时尿嘧啶（U）全部转化为胸腺嘧啶（T），最后连接⼆代测序接头进⾏高通量测序，利用数据分析就能判断CpG位点是否发生甲基化。TBS技术可满足几个到几百个基因或位点的验证需求，具有高准确率、⾼通量、低成本、周期短等优势。

技术路线：

样本要求：

细胞：≥5×10⁶个

动物：≥10mg

基因组DNA：≥3μg

DNA浓度：≥50ng/μl

建库测序：

测序策略：NovaSeq6000

测序深度：≥200X

项目周期：

35个⼯作⽇

案例分享

【项⽬⽂章】HOXD1抑制肺腺癌进展，并受DNA甲基化调控

HOXD1 inhibits lung adenocarcinoma progression and is regulated by DNA methylation

期刊：Oncology Reports｜影响因⼦：3.8｜发表时间：2024年｜发表单位：⼭东第⼀医科⼤学

研究背景：

非小细胞肺癌（NSCLC）是肺癌中最常见的类型，占所有肺癌病理类型的80%～85%。尽管在NSCLC的早期检测策略和治疗方面取得了一定的进展，但识别新的生物标志物对于指导NSCLC的预后仍然非常重要。在肺癌研究中，HOXD基因的异常表达与肺腺癌（LUAD）的发生和进展有关，但关于HOXD1在肺癌中的作用尚不清楚。

研究结果：

体外研究表明HOXD1过表达抑制了LUAD细胞的增殖、迁移和侵袭。在小鼠肿瘤模型中，HOXD1的上调被证明可以抑制肿瘤生长。进一步地，研究者通过靶向亚硫酸盐测序TBS和染色质免疫沉淀ChIP实验，发现HOXD1基因启动子区域发生了DNA超甲基化，并与DNA甲基转移酶（DNMTs）的作用相关。此外，上调的HOXD1作为转录因子，ChIP-seq实验及RT-PCR结果显示HOXD1增加了骨形态发生蛋白BMP2和BMP6的转录表达。