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武汉爱基百客生物科技有限公司(简称爱基百客),位于武汉高农生物园,办公面积逾3000平方米,是一家专注于表观组学、单细胞时空组学和高通量测序分析服务的新型生物科技企业。


公司旨在为客户提供专业的科研服务,运营至今合作的科研客户近千家,涵盖国内知名科研院所、高校以及相关生物企业,运营至今销售额超1亿元,科研成果曾多次在Science、Cancer Cell、Plant Cell、Nature Communications、J HEMATOL ONCOL等国际高水平学术期刊发表,受到了客户广泛好评,是国内成长最迅速的多组学科研服务企业之一。

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TECHNOLOGY SERVICE

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详细说明

DAP-seq

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  • 案例分享

DAP-seq(DNA affinity purification sequencing)

产品介绍:

DAP-Seq是将蛋白质体外表达技术与高通量测序技术相结合,使用体外表达的TF蛋白对裸露的全基因组DNA片段进行孵育,以确定结合序列。

通过提取基因组DNA,进行基因DNA文库构建。随后利用HaloTag载体,将目的蛋白HaloTag融合表达,将纯化的融合蛋白与基因组文库进行孵育,利用目的蛋白结合DNA片段,并且利用HaloTag特异性磁珠,将目的蛋白DNA复合物进行提取与纯化,随后对捕获的DNA片段进行扩增,测序分析,探究目的蛋白结合的DNA片段。

DAP原理图.png

DAP-seq实验流程


分析流程:

DAP分析流程.png


产品优势:

DAP产品优势.png


项目经验

DAP项目经验.png


样本要求:

植物组织5g

包含转录因子CDS序列的质粒:1-2μg(质粒浓度为200 ng/μL)。(需保证质粒测序结果无误)


建库测序:

测序策略:NovaSeq6000, PE150

测序深度6-12 G


项目周期:

60个工作日


案例分析

【项⽬⽂章】WRKY27-RAP2.7调控模块通过调节肉桂醇脱氢酶7和谷胱甘肽S-转移酶F6,以此调控木质素生物合成和氧化还原稳态,进而促进耐冷性

WRKY27-RAP2.7 Regulatory Module Promotes Cold  Tolerance via Modulation of Lignin Biosynthesis and  Redox Homeostasis by Regulating Cinnamyl Alcohol  Dehydrogenase 7 and Glutathione S-Transferase F6

期刊:Plant Biotechnology Journal|影响因⼦:10.5|发表时间:2025年|发表单位:华中农业大学


研究背景:

  低温胁迫会对植物的生长发育产生不利影响,严重制约柑橘果实的产量和品质。宜昌橙(Citrus ichangensis)作为一种耐寒柑橘种质,是研究耐寒适应性的宝贵遗传资源,但目前关于其低温胁迫响应背后的关键基因及其作用机制仍鲜有探索。

研究结果:

通过DAP-seq和RNA-seq揭示了通过调控CiCAD7介导的桔皮素生物合成和CiGSTF6依赖的ROS清除来调节抗寒性,此外,CiWRKY27还与受其调控的CiRAP2.7蛋白相互作用,形成一个关键的抗寒调控模块。为深入了解低温胁迫下桔皮素生物合成和ROS稳态的分子调控机制提供了有价值的信息,为柑橘等作物抗寒性的改良提供了有前景的分子模型。

image.png

图3 基于 DAP-seq 技术的CiWRKY27结合位点全基因组鉴定




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