标题

科研服务实验室

符合国家IS0 9001标准，实验操作流程实行内部管理标准化、可追溯。
样本处理及建库系统

样本处理及建库系统 / 二代测序系统
二代测序系统

二代测序系统

首页

加入我们

关于我们

武汉爱基百客生物科技有限公司（简称爱基百客），位于武汉高农生物园，办公面积逾3000平方米，是一家专注于表观组学、单细胞时空组学和高通量测序分析服务的新型生物科技企业。

公司旨在为客户提供专业的科研服务，运营至今合作的科研客户近千家，涵盖国内知名科研院所、高校以及相关生物企业，运营至今销售额超1亿元，科研成果曾多次在Science、Cancer Cell、Plant Cell、Nature Communications、J HEMATOL ONCOL等国际高水平学术期刊发表，受到了客户广泛好评，是国内成长最迅速的多组学科研服务企业之一。

加入我们

核酸蛋白互作组学

基因组相关研究

多组学

核酸甲基化修饰

染色质图谱

转录调控相关研究

单细胞时空组学

综合项目服务

三代测序

网站首页

TECHNOLOGY SERVICE

科技服务

网站首页 >> 科技服务 >>基因组相关研究 >> 全基因组重测序

详细说明

全基因组重测序

产品介绍
案例分析

全基因组重测序（Whole Genome Resequencing）

产品介绍：

全基因组重测序（WGS）是对已知基因组序列的物种进⾏不同个体的基因组测序，并在此基础上对个体或群体进⾏差异性分析。全基因组重测序的个体，通过序列⽐对，可以找到⼤量的单核苷酸多态性位点（SNP，Single Nucleotide Polymorphism）、拷⻉数变异（CNV，Copy Number Variation）、插⼊缺失（InDel，Insertion/Deletion）、结构变异（SV，Structure Variation）等信息，从⽽应⽤于检测致病基因、遗传变异、产前筛查、个性化医疗等众多领域。

技术路线：

技术应用：

样本要求：

细胞：≥5×106个

动物组织：≥0.2 g

植物组织：≥2 g

真核微生物：5×10⁶个或≥300mg

建库测序：

测序策略：PE150

测序深度：10×以上

项目周期：

55个工作日

案例分析

【项⽬⽂章】《杯伞科（口蘑亚目，伞菌目）的系统分类：基于系统发育与系统基因组学证据、形态学数据及毒蕈碱产生特性的演化创新》

Systematic arrangement within the family Clitocybaceae (Tricholomatineae, Agaricales): phylogenetic and phylogenomic evidence, morphological data and muscarine‑producing innovation

期刊：Fungal Diversity｜影响因⼦：20.3｜发表时间：2023年｜发表单位：中国科学院昆明植物研究所

研究背景：

Clitocybaceae（杯伞科）是近期建立的真菌家族。目前，由于取样和用于系统发育分析的基因有限，该家族内的亚科分化和关系尚不清晰。该家族的一些蘑菇含有神经毒性毒蕈碱，导致全球范围内许多严重甚至致命的中毒事件。然而，该家族内毒素的分类分布和演化大部分仍然未知。

研究结果：

该研究基于ITS和六个分子位点（ITS、LSU、TEF1、RPB1、RPB2和ATP6）的核苷酸序列进行了系统发育分析，同时进行了基于485个单拷贝同源基因的系统发育基因组学分析。采用BEAST分析法来估计家族内的分化时间，并对32个代表性物种的毒蕈碱进行了生化分析。

基于这些分析，提出了Clitocybaceae的更新分类，包括六个属：杯伞属（Clitocybe）、金钱菌属（Collybia）、树状金钱菌属（Dendrocollybia）、香蘑属（Lepista）、假离褶伞属（Pseudolyophyllum）和囊泡杯伞属（Singerocybe）。还提出了17种中国新种和15种新组合。此外，在18种物种中检测到毒蕈碱，这些含毒蕈碱的物种在Collybia亚属中形成了一个主要的单系分支。最后，系统发育、系统发育基因组学、化学分类和分子测定年龄结果表明，Clitocybaceae是一个自然群，估计起源于约6000万年前，并且在该家族中，毒蕈碱大约在2000万年前仅经过一次独立演化，并且之后未发生丢失。