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武汉爱基百客生物科技有限公司(简称爱基百客),位于武汉高农生物园,办公面积逾3000m2,是一家专业提供单细胞与空间组学测序分析、表观组学科研服务和高通量测序分析的新型生物科技服务企业。

公司旨在为客户提供最专业的科研服务,运营至今合作的科研客户近千家,涵盖国内知名科研院所、高校以及相关生物企业,运营至今销售额超1亿元,科研成果曾多次在Cancer Cell、Plant Cell、Nature Communications、J HEMATOL ONCOL等国际高水平学术期刊发表,受到了客户广泛好评,是国内成长最迅速的高通量测序科研服务企业之一。

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网站首页 >> 科技服务 >>转录调控相关研究 >> 真核转录组(RNA-seq)
详细说明

真核转录组(RNA-seq)

  • 产品介绍
  • 案例分享

RNA-seq


产品介绍:

转录组,广义上指某一生理条件下,细胞内所有转录产物的集合,包括mRNArRNAtRNA以及其他非编码RNA,狭义上的转录组指的是所有mRNA的集合。目前转录组检测的是所有mRNA集合。

转录组测序指利用新一代高通量测序技术,全面快速获取某一物种特定组织或器官在某一状态下的所有mRNA的序列信息。


分析流程:

image.png

 

样本要求:

细胞:≥1×106 

动物组织:≥1g

植物组织:3 g

真核微生物:300mg/106


建库测序:

测序策略:PE150

测序深度:6 G


项目周期:

45个工作日


 

案例分享

【项⽬⽂章】蛋⽩精氨酸甲基转移酶PRMT1通过调节转录因⼦C/EBPβ和PPARγ促进脂肪⽣成》

ProteinargininemethyltransferasePRMT1promotesadipogenesisbymodulatingtranscriptionfactorsC/EBPβ andPPARγ

期刊:J Biol Chem|影响因⼦:5.486|发表时间:2022年|发表单位:中⼭⼤学



研究背景:

肥胖是由⽩⾊脂肪组织过度扩张引起的脂质代谢异常,有研究表明蛋⽩质精氨酸甲基转移酶 PRMT1 与脂肪形成密切相关,但其在脂肪形成中的功能和潜在机制尚不清楚 。此外,在脂肪形成的过程中,转录因⼦ CCATT 增强⼦结合蛋⽩β(C/EBPβ)和过氧化物酶体增殖物激活受体-γ (PPARγ )也发挥重要作⽤。因此,了解影响 PPARγC/EBPβ 表达和活性的调控因⼦对深⼊研究脂肪形成的机制具有重要意义。


研究结果:

为了基本了解 PRMT1 对脂肪形成的影响,并探索潜在的靶基因,研究对对照组和 PRMT1 敲除3T3-L1 细胞进⾏了 RNA 测序,经 DMI 处理1天(MCE期)和3天(分化期)。然后,对差异表达基因进⾏GO富集分析,结果表明 PRMT1 参与了脂肪细胞分化和脂质代谢的适当调控。

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图:RNA测序分析



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