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武汉爱基百客生物科技有限公司(简称爱基百客),注册于2014年12月31日,次年10月正式开始对外运营,是一家专业提供表观组学技术服务、高通量测序、单细胞测序分析的新型生物科技服务企业。

公司总员工已达到百余人,其中95%以上具有学士学位,40%以上具有硕士及以上学位,专职科研人员20余人,专职销售人员30余人,覆盖全国90%的省市,核心成员来自国内知名高效、基因测序公司、信息分析公司等。

公司运营至今销售额累积1亿左右,成为国内成长最迅速的二代测序与生物科研服务企业之一。




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RNA-seq

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RNA-seq


产品介绍:

转录组,广义上指某一生理条件下,细胞内所有转录产物的集合,包括mRNArRNAtRNA以及其他非编码RNA,狭义上的转录组指的是所有mRNA的集合。目前转录组检测的是所有mRNA集合。

转录组测序指利用新一代高通量测序技术,全面快速获取某一物种特定组织或器官在某一状态下的所有mRNA的序列信息。


技术流程:

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样本要求:

细胞:>1×108 

动物组织:≥0.5 g

植物组织5 g

真核微生物:1 g


建库测序:

测序策略:Illumina Hiseq, PE150

测序深度:12-20 G


项目周期:

45个工作日


 

案例分享

月季“月月红”热应激反应的关键因素和信号传导途径的转录组比较分析》

Comparative transcriptome analysis of Rosa chinensis ‘Slater's crimson China’ provides insights into the crucial factors and signaling pathways in heat stress response. Plant Physiology and Biochemistry. 2019,142:312-331.(IF=3.404)


研究背景:

热胁迫限制了月季的生长,并且不利地影响了月季切花的产量和质量。但是月季的热应激反应(HSR)机制目前尚未完全清楚。


研究结果:

鉴定了6175个差异表达基因(DGE),它们表现出不同的时间表达模式。热处理0.52h后,与伴侣蛋白介导的蛋白质折叠,信号转导和ROS清除相关的上调基因被迅速诱导,这为月季的热应激反应的早期调节提供了证据。在短短6h的热胁迫下就发现了与光反应,蔗糖生物合成,淀粉生物合成和细胞壁生物合成相关的基因下调,这表明其对月季的生理作用一直在发挥负面作用。在将转录因子与共表达基因的上游富集DNA基序整合到这些模块中的基础上,预测并调控了基因调控网络。确定了几个HSR的调节器。特别重要的是发现了与快速传感和信号转导相关的模块,其中鉴定了与分子伴侣、Ca 2+信号传导途径和转录因子相关的许多共表达基因。

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图:月季不同处理后的转录调控网络



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