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武汉爱基百客生物科技有限公司(简称爱基百客),位于武汉高农生物园,办公面积逾3000平方米,是一家专注于表观组学、单细胞时空组学和高通量测序分析服务的新型生物科技企业。


公司旨在为客户提供专业的科研服务,运营至今合作的科研客户近千家,涵盖国内知名科研院所、高校以及相关生物企业,运营至今销售额超1亿元,科研成果曾多次在Science、Cancer Cell、Plant Cell、Nature Communications、J HEMATOL ONCOL等国际高水平学术期刊发表,受到了客户广泛好评,是国内成长最迅速的多组学科研服务企业之一。

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网站首页 >> 科技服务 >>转录调控相关研究 >> 真核转录组(RNA-seq)
详细说明

真核转录组(RNA-seq)

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  • 案例分享

RNA-seq


产品介绍:

转录组,广义上指某一生理条件下,细胞内所有转录产物的集合,包括mRNArRNAtRNA以及其他非编码RNA,狭义上的转录组指的是所有mRNA的集合。目前转录组检测的是所有mRNA集合。

转录组测序指利用新一代高通量测序技术,全面快速获取某一物种特定组织或器官在某一状态下的所有mRNA的序列信息。


分析流程:

image.png

 

样本要求:

细胞:≥1×106 

动物组织:≥1g

植物组织:3 g

真核微生物:300mg/106


建库测序:

测序策略:PE150

测序深度:6 G


项目周期:

45个工作日


 

案例分享

【项⽬⽂章】《G9a-TRIM21轴通过诱导FoxO3a发生甲基化依赖性泛素化和降解,进而促进氧化应激和细胞焦亡,从而加剧糖尿病肾缺血再灌注损伤》

The G9a-TRIM21 axis exacerbates diabetic renal ischemia-reperfusion injury by inducing methylation-dependent ubiquitination and degradation of FoxO3a to promote oxidative stress and pyroptosis

期刊:Redox Biology|影响因⼦:11.9|发表时间:2025年|发表单位:武汉大学人民医院


研究背景:

糖尿病肾缺血再灌注损伤(RIRI)是一种严重的手术并发症,在糖尿病患者中预后尤为不良。组蛋白甲基转移酶G9a已牵涉于多种病理过程,但其在糖尿病RIRI中的作用尚不清楚。新兴证据表明,非组蛋白甲基化可能在细胞应对缺血性损伤的反应中发挥关键作用。本研究旨在探讨G9a在糖尿病RIRI中的功能性作用并阐明其分子机制,特别关注其对FoxO3a稳定性、氧化应激和细胞焦亡的调控。

研究结果:

研究在高糖条件下利用G9a条件性敲除小鼠和HK-2细胞建立了糖尿病RIRI模型。通过检测血清肌酐和尿素氮(BUN)评估肾功能。进行了组织病理学评估和分子分析,以检测组织损伤和焦亡标志物。机制研究包括利用质谱鉴定G9a相互作用蛋白,利用免疫共沉淀验证蛋白相互作用,以及利用泛素化实验表征翻译后修饰。采用定点突变技术鉴定FoxO3a调控中的关键残基。在糖尿病RIRI模型中,G9a表达显著上调。在体内和体外模型中,G9a的基因敲除均减轻了肾损伤,并降低了氧化应激和细胞焦亡。机制上,G9a直接与FoxO3a相互作用并在赖氨酸262位点对其进行甲基化,这促进了E3泛素连接酶TRIM21对FoxO3a的识别。随后,TRIM21介导了FoxO3a在赖氨酸176位点的K48连接的多泛素化,导致其经蛋白酶体途径降解。这种G9a介导的FoxO3a降解促进了氧化应激、NLRP3炎症小体激活和细胞焦亡。重要的是,使用BIX-01294药理学抑制G9a或过表达FoxO3a均显著改善了糖尿病RIRI。本研究揭示了糖尿病RIRI中存在一种新型的G9a-TRIM21-FoxO3a调控轴,其中G9a介导的甲基化许可了FoxO3a的泛素化和降解,从而促进细胞焦亡和氧化应激。这些发现表明G9a是预防或治疗糖尿病肾缺血再灌注损伤的潜在治疗靶点。

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图:DM加剧RIRI并上调G9a表达



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