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武汉爱基百客生物科技有限公司(简称爱基百客),位于武汉高农生物园,办公面积逾3000m2,是一家专业提供单细胞与空间组学测序分析、表观组学科研服务和高通量测序分析的新型生物科技服务企业。

公司旨在为客户提供最专业的科研服务,运营至今合作的科研客户近千家,涵盖国内知名科研院所、高校以及相关生物企业,运营至今销售额超1亿元,科研成果曾多次在Cancer Cell、Plant Cell、Nature Communications、J HEMATOL ONCOL等国际高水平学术期刊发表,受到了客户广泛好评,是国内成长最迅速的高通量测序科研服务企业之一。

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TECHNOLOGY SERVICE

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详细说明

Smart-seq2

  • 商品说明

Smart-seq2


产品介绍

  单细胞测序技术在科研领域已得到了广泛的应用,尤其是肿瘤、免疫、细胞发育、病毒感染、用 药指导及靶标筛选等研究领域。目前,主流的单细胞解决方案除了10xGenomics Chromium外,还 有Smart-seq2技术。Smart-seq技术于2012年公布,Smart-seq2是升级版技术。Smart-seq2是可以 检测mRNA全长的单细胞转录组测序技术,也可用于分析可变剪切。 

  Smart-seq2技术利用ol igo-dT30VN作为反转录起始引物进行逆转录,逆转录至mRNA的5’端 帽子结构时,利用MMLV酶的模板置换的活性,利用TSO作为模板,继续逆转录,进而添加5’通用 序列。其具有模板起始量低、转录本覆盖度高、碱基分辨率高和检测灵敏度高等优势,但只能分析 带poly A的RNA,RNA质量要求高,且检测的是非链特异性RNA。Smart-seq2技术对于样本量少、特 殊样本(比如生殖细胞)有较好的适配性。


技术流程

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分析流程

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样本要求

·真核生物(动物),mRNA 具有 Poly(A)结构; 

·单细胞:细胞直径大于 10μm; 

·微量细胞:细胞数目在 200 个以下; 

·微量total RNA:一般要求 RNA 28S/18S≥1,  RIN≥7,浓度>50pg/μL。


建库测序:

·测序策略:Illnumina PE150 

·测序深度:6G


项目周期:

·60个工作日


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(市场部

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公司主要提供表观组学技术服务、NGS测序服务、单细胞测序服务

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