Smart-seq2

Smart-seq2

产品介绍：

  单细胞测序技术在科研领域已得到了广泛的应用，尤其是肿瘤、免疫、细胞发育、病毒感染、用 药指导及靶标筛选等研究领域。目前，主流的单细胞解决方案除了10xGenomics Chromium外，还 有Smart-seq2技术。Smart-seq技术于2012年公布，Smart-seq2是升级版技术。Smart-seq2是可以 检测mRNA全长的单细胞转录组测序技术，也可用于分析可变剪切。 

  Smart-seq2技术利用ol igo-dT30VN作为反转录起始引物进行逆转录，逆转录至mRNA的5’端 帽子结构时，利用MMLV酶的模板置换的活性，利用TSO作为模板，继续逆转录，进而添加5’通用 序列。其具有模板起始量低、转录本覆盖度高、碱基分辨率高和检测灵敏度高等优势，但只能分析 带poly A的RNA，RNA质量要求高，且检测的是非链特异性RNA。Smart-seq2技术对于样本量少、特 殊样本（比如生殖细胞）有较好的适配性。

技术流程：

分析流程：

样本要求：

·真核生物（动物），mRNA 具有 Poly(A)结构； 

·单细胞：细胞直径大于 10μm； 

·微量细胞：细胞数目在 200 个以下； 

·微量total RNA：一般要求 RNA 28S/18S≥1，  RIN≥7，浓度＞50pg/μL。

建库测序：

·测序策略：Illnumina PE150 

·测序深度：6G

项目周期：

·60个工作日