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武汉爱基百客生物科技有限公司(简称爱基百客),注册于2014年12月31日,次年10月正式开始对外运营,是一家专业提供表观组学技术服务、高通量测序、单细胞测序分析的新型生物科技服务企业。

公司总员工已达到百余人,其中95%以上具有学士学位,40%以上具有硕士及以上学位,专职科研人员20余人,专职销售人员30余人,覆盖全国90%的省市,核心成员来自国内知名高效、基因测序公司、信息分析公司等。

公司运营至今销售额累积1亿左右,成为国内成长最迅速的二代测序与生物科研服务企业之一。




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LncRNA-seq

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LncRNA-seq


产品介绍:

长链非编码RNA(Long non-coding RNA, lncRNA)是长度大于 200 个核苷酸的非编码 RNA。研究表明, lncRNA 在表观遗传调控、细胞周期调控和细胞分化调控等众多生命活动中发挥重要作用。它主要是利用高通量测序技术进行lncRNA测序,并结合生物信息学的预测工具进行lncRNA分析,,分析lncRNA与特定生物学过程的关系。该方法可以更加高效地获取lncRNA序列以及位置信息,且突破了常规lncRNA芯片检测技术的使用范围限制,还可对新的lncRNA进行预测及功能分析,极大促进lncRNA的深入研究。


技术流程:

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样本要求:

细胞:1×108 

动物组织:0.5 g

植物组织5 g

真核微生物:1 g

 

建库测序:

测序策略:Illumina Hiseq, PE150

测序深度:12-20 G

适用范围:有参考基因组物种


项目周期:

45个工作日


 
 
 


案例分享

利用CRISPR敲除突变体对秀丽隐杆线虫lincRNAs进行系统评价

Systematic evaluation of C. elegans lincRNAs with CRISPR knockout mutants.Genome Biology, 2019, 20:7.IF=14.028


研究背景:

长基因间RNA(lincRNAs)在真核细胞中起着关键作用,但对动物的lincRNAs表型缺乏系统的分析。


研究结果:

获得了170LincRNA并依据这些lincRNA获得了150个基因敲除秀丽隐杆线虫突变株,对这些突变株进行特征分析获得了23个突变株具有6个表型特征。一些秀丽隐杆线虫的lncRNA顺式调控其邻近基因的表达,而一些LincRNA则起反式调控作用来对抗microRNA。还研究了转录因子对lincRNA表达的调控,并分析了两个转录因子UNC-30UNC-55共同调控linc-73表达的途径。此外,linc-73具有顺式调控其邻近的肌动蛋白基因unc-104表达的功能,从而在秀丽隐杆线虫的运动中发挥作用。

图片51.png

图:LncRNAmiRNA的共表达调控网络



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