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样本处理及建库系统 / 二代测序系统
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武汉爱基百客生物科技有限公司（简称爱基百客），位于武汉高农生物园，办公面积逾3000m2，是一家专业提供单细胞与空间组学测序分析、表观组学科研服务和高通量测序分析的新型生物科技服务企业。

公司旨在为客户提供最专业的科研服务，运营至今合作的科研客户近千家，涵盖国内知名科研院所、高校以及相关生物企业，运营至今销售额超1亿元，科研成果曾多次在Cancer Cell、Plant Cell、Nature Communications、J HEMATOL ONCOL等国际高水平学术期刊发表，受到了客户广泛好评，是国内成长最迅速的表观生物学、二代测序与生物科研服务企业之一。

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网站首页 >> 科技服务 >>转录调控相关研究 >> LncRNA-seq

详细说明

LncRNA-seq

产品介绍
案例分享

LncRNA-seq

产品介绍：

长链非编码RNA(Long non-coding RNA, lncRNA)是长度大于 200 个核苷酸的非编码 RNA。研究表明, lncRNA 在表观遗传调控、细胞周期调控和细胞分化调控等众多生命活动中发挥重要作用。它主要是利用高通量测序技术进行lncRNA测序，并结合生物信息学的预测工具进行lncRNA分析，，分析lncRNA与特定生物学过程的关系。该方法可以更加高效地获取lncRNA序列以及位置信息，且突破了常规lncRNA芯片检测技术的使用范围限制，还可对新的lncRNA进行预测及功能分析，极大促进lncRNA的深入研究。

技术流程：

样本要求：

细胞：＞1×10⁸个

动物组织：≥0.5 g

植物组织：≥5 g

真核微生物：1 g

建库测序：

测序策略：Illumina Hiseq, PE150

测序深度：12-20 G

适用范围：有参考基因组物种

项目周期：

45个工作日

案例分享

《利用CRISPR敲除突变体对秀丽隐杆线虫lincRNAs进行系统评价》

Systematic evaluation of C. elegans lincRNAs with CRISPR knockout mutants.Genome Biology, 2019, 20:7.（IF=14.028）

研究背景：

长基因间RNA(lincRNAs)在真核细胞中起着关键作用，但对动物的lincRNAs表型缺乏系统的分析。

研究结果：

获得了170个LincRNA并依据这些lincRNA获得了150个基因敲除秀丽隐杆线虫突变株，对这些突变株进行特征分析获得了23个突变株具有6个表型特征。一些秀丽隐杆线虫的lncRNA顺式调控其邻近基因的表达，而一些LincRNA则起反式调控作用来对抗microRNA。还研究了转录因子对lincRNA表达的调控，并分析了两个转录因子UNC-30和UNC-55共同调控linc-73表达的途径。此外，linc-73具有顺式调控其邻近的肌动蛋白基因unc-104表达的功能，从而在秀丽隐杆线虫的运动中发挥作用。