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样本处理及建库系统 / 二代测序系统
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武汉爱基百客生物科技有限公司（简称爱基百客），位于武汉高农生物园，办公面积逾3000m2，是一家专业提供单细胞与空间组学测序分析、表观组学科研服务和高通量测序分析的新型生物科技服务企业。

公司旨在为客户提供最专业的科研服务，运营至今合作的科研客户近千家，涵盖国内知名科研院所、高校以及相关生物企业，运营至今销售额超1亿元，科研成果曾多次在Science、Cancer Cell、Plant Cell、Nature Communications、J HEMATOL ONCOL等国际高水平学术期刊发表，受到了客户广泛好评，是国内成长最迅速的高通量测序科研服务企业之一。

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网站首页 >> 科技服务 >>转录调控相关研究 >> LncRNA-seq

详细说明

LncRNA-seq

产品介绍
案例分享

LncRNA-seq

产品介绍：

长链非编码 RNA(Long non-coding RNA, lncRNA)是长度⼤于200个核苷酸的非编码RNA。研究表明,lncRNA在表观遗传调控、细胞周期调控和细胞分化调控等众多⽣命活动中发挥重要作用。它主要是利用高通量测序技术进⾏lncRNA 测序，并结合⽣物信息学的预测工具进⾏lncRNA 分析，分析lncRNA与特定生物学过程的关系。该方法可以更加高效地获取lncRNA 序列以及位置信息，且突破了常规lncRNA芯片检测技术的使用范围限制，还可对新的lncRNA 进行预测及功能分析，极大促进lncRNA的深入研究。

技术流程：

样本要求：

细胞：≥1×10⁶个

动物组织：≥1 g

植物组织：≥5 g

真核微生物：300mg/10⁶

建库测序：

测序策略：NovaSeq6000，PE150

测序深度：12-20 G

项目周期：

45个工作日

案例分享

《LncRNAFIRRE通过与PTBP1相互作用，作为肿瘤启动子稳定BECN1mRNA，促进自噬》

LncRNAFIRREfunctionsasatumorpromoterbyinteractionwithPTBP1tostabilizeBECN1mRNAandfacilitateautophagy

期刊：CellDeath&Disease｜影响因⼦：9.685｜发表时间：2022年｜发表单位：复旦⼤学

研究背景：

⻓链⾮编码RNA（lncRNAs）在各种癌症中起着关键作⽤。Firre基因间重复 RNA 元件（FIRRE）是⼀个位于细胞核内的lncRNA，在结肠直肠癌（CRC）中过表达。然⽽，FIRRE在结直肠癌中的具体机制尚不明确。

研究结果：

通过HE染⾊区分癌变组织和正常组织。通过⾼通量测序（LncRNA-seq)来评估肿瘤和邻近正常组织配对组织中 lncRNA 表达的差异情况。火山图揭示了整体的基因表达水平。其中，FIRRE在肿瘤组织中过表达。CRC细胞系的qPCR结果显⽰，FIRRE在癌细胞中过表达。然后，作者利⽤ RNA pull-down、RIP、细胞周期测定等⼀系列实验发现FIRRE在结直肠癌中作为⼀种致癌因⼦，通过稳定BECN1 mRNA诱导肿瘤的发展,以及以 PTBP-1介导的⽅式促进⾃噬。