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武汉爱基百客生物科技有限公司(简称爱基百客),注册于2014年12月31日,次年10月正式开始对外运营,是一家专业提供表观组学技术服务、高通量测序、单细胞测序分析的新型生物科技服务企业。

公司总员工已达到百余人,其中95%以上具有学士学位,40%以上具有硕士及以上学位,专职科研人员20余人,专职销售人员30余人,覆盖全国90%的省市,核心成员来自国内知名高效、基因测序公司、信息分析公司等。

公司运营至今销售额累积1亿左右,成为国内成长最迅速的二代测序与生物科研服务企业之一。




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详细内容

万能研究思路:转录组+染色质开放性

课题方向——无从下手一头雾水???

完成测序——分析数据毫无亮点???

分析结果——如何写入文章???

科研生活枯燥无味,各种数据、各种考核、各种材料,怎么利用?怎么组合?

爱基百客技术小哥通过阅读近几年上百篇科研热点文章,发现一个快、好、省的万能科研思路,应用范围极广,它就是:

染色质开放性+转录组

ATAC-Seq+RNA-Seq


研究背景


ATAC-seq是通过用Tn5转座酶探测开放的染色质来鉴定可接近的DNA区域,纯化标记的DNA片段,通过PCR扩增后测序,然后利用测序reads推断可接近DNA区域以及转录因子结合位点和核小体位置的区域。

转录组测序是研究基因表达的常用手段,众所周知基因的表达是需要转录起始复合物(Transcription preinitiation complex, PIC)与DNA结合,完成转录过程。发生转录的区域一定是一个开放性的区域,这也是为什么常染色体上基因活跃而异染色体上基因沉默。

ATAC-seq和RNA-seq联合实验的意义。一方面阐述了哪些基因由于开放性的改变而导致了差异表达,另一方面,根据开放性区域的不同,更加精准的预测哪些转录因子对于目标基因具有调控功能,为目标基因的调控机制提供了方向。结合转录因子等的不同导致生命调控的复杂性,染色质区域的开放性与基因的调控关系成为科研学者关注热点。

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应用方向

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案例解读

动物篇

Tittle:Integrative ATAC-seq and RNA-seq Analysis of the Longissimus Muscle of Luchuan and Duroc Pigs

发表时间:2021年9月份,

发表杂志: Frontiers in Nutrition(IF :6.57)

材料:陆川猪、杜洛克猪(各三个生物学重复)

研究内容:陆川猪和杜洛克猪两个不同品种的猪在骨骼肌发育方面表现有巨大差异,作者针对同样时期的两个品种猪的背Z长肌进行取样,随后进行ATAC-seq、RNA-seq,对ATAC-seq中鉴定得到的差异开放性区域和RNA-seq中鉴定获得的差异表达基因进行了关联分析,得到Overlap的基因后进行注释和富集分析,找到了和骨骼肌发育的关键基因并进行了RT-qPCR。


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植物篇

Tittle:Chromatin Accessibility Is Associated with Artemisinin Biosynthesis Regulation in Artemisia annua

发表时间:2021 年 2 月,

发表杂志: Molecules (IF : 4.4)

材料:青蒿的腺毛和叶片(青蒿素合成的不同部位),每个样本两个重复

研究内容:针对两个不同部位进行了ATAC-seq和RNA-seq,联合分析获得一些候选基因,对其进行功能和代谢通路注释,针对青蒿素合成关键基因进行了展示,基本文章内容已经完成。

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我们提供什么?

多:收集40多篇相关研究参考文献,整理成册,后期也会针对性解读;

快:建库测序分析一站式服务,极速交付周期;

:30多项个性化分析,不愁文章没亮点;一对一技术支持,手把手结果解读;

:4月肆意放价,做ATAC-Seq送RNA-Seq;打包个性化分析,巨折优惠。


欲知更多详情,请持续关注小编。。。。。。

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