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单细胞技术一些不成熟的想法最开始听到单细胞实验时,第一时间脑海里反应的是单个细胞还能影响一个疾病不成?随着越来越多的疾病研究应用了单细胞的实验方法,这种观念仍然困扰着我。也许是我的认知太狭隘,所以影响了我的大脑发挥O(∩_∩)O~。 尤其是这种困扰我的认知导致单细胞在植物方面的应用更难以接受。 目前我看到的文献来说,我觉得单细胞技术虽然能在单细胞层面了解每个细胞的遗传信息,但是最后分析时通过分群,最后的研究还是立足于一类细胞,只不过我们常规的bulk测序难以将这一类具有共同表达信息的细胞归类到一起,从而无法达到单细胞研究的技术优势。 就这个认知来说,单细胞技术的细胞分群真的是革新技术。通过无差别分群或者已经报道的marker基因进行分群,将获得的单细胞分成不同的细胞类群,再对不同的细胞类群进行基因注释以及差异基因分析等等,常规的bulk转录组分析的内容都可以应用到单细胞技术上。 在人和动物组织中,每个组织里可能包含了很多相似的细胞类型,如免疫细胞,尤其是这些免疫细胞在疾病发生和治疗中起主要作用。 但是在植物中是否也存在类似的作用呢? 通过翻阅植物单细胞的文章,归纳总结来说,植物也存在类似作用,真正研究单细胞层面,实则是探究单类群细胞在植物样本中不同部位行使的功能,当然了,鉴于单细胞技术在植物中应用的瓶颈,植物单细胞的研究还不够透彻,研究的物种还不太多,随着技术的发展,未来植物单细胞的研究会更加丰富。 还有一个问题在于,我对单细胞技术应用在疾病中的理论是单细胞技术分群后的细胞类群来进行疾病研究,但是在应用这种大规模单细胞分离建库分析的技术之前,有研究只对部分细胞甚至几个细胞的研究,这样的研究还有意义么?意义在哪里呢? 对于这个问题,最初问出来时,确实还是很困惑的一件事情,到了现在,看了很多单细胞的文章,越来越觉得,单细胞技术从最初的只能做1个细胞,到后来的几十个细胞,几百个细胞,然后是几千个细胞,到现在1万个细胞,甚至是近期推出的百万细胞级别,这些深度细胞的测序研究,最关键的就是准确性。细胞数量较少,得出的理论结论可能不太准确,需要大量细胞来进行探究佐证。但是之前的研究没有用了么?这个也不是的,所有科学的发展,都是离不开前人的探究,科学都是在前人研究的基础上不断革新升级。另外,植物单细胞技术发展,有个很大的问题就是植物的基因在不同的物种中变异较大,在细胞分群鉴定时,是比较困难的,那前人针对部分细胞或者单个细胞的研究,对于高通量细胞群鉴定是十分关键的,毕竟前人研究时,细胞类型是已知的,通过这种基因表达情况的对比分析来对植物细胞分群是非常有效的。 在单细胞技术学习过程中,不断的摸索提问回答提问回答,相信不止我个人有非常多的疑问与疑惑,所以关于单细胞的学习,我也会不定时的更新自我见解,也欢迎有不同想法的人来共同探讨。 |