2篇IF>10项目文章连发，组蛋白修饰在猪脂肪组织及太平洋亚历山大藻中的应用

文章一：猪脂肪组织增重和减重过程中染色质结构的动态变化

题目：Dynamic chromatin architecture of theporcine adipose tissues with weight gain and loss

发表单位：四川农业大学与中科院北京基因组研究所

发表日期：2023年6月12日

发表期刊：Nature communications

影响因子：17.694

爱基提供技术：ChIP-seq技术服务

摘要：使用一个成年雌性微型猪模型（猪的增重和减重模型），该研究探究了与肥胖相关的脂肪组织（ATs）中三维基因组结构的调控机制，生成了249个皮下AT和3个内脏AT的Hi-C染色质三维图谱，并联合RNA-seq和ChIP-seq等多组学分析了不同营养处理下转录组和染色质结构的变化以及转录调控机制。

研究发现，染色质结构重构支持了脂肪组织的转录组差异可能与肥胖发展中的代谢风险有关。对不同哺乳动物皮下脂肪组织之间染色质结构的分析表明，存在转录调控差异，这可以解释脂肪组织的表型、生理和功能差异。猪和人类的调控元件保守分析揭示了肥胖表型基因调节回路的相似性，并识别出支持脂肪组织特异的物种特异性基因集的非保守元件。这项研究为发现人类和猪的肥胖相关调节元件提供了一个数据丰富的信息资源。

联合Hi-C、H3K27ac ChIP-seq和RNA-seq数据

文章二：H3K79甲基化通过增加光合作用促进太平洋亚历山大藻在高光强下的快速生长

题目：H3K79 methylation promotes rapid growth of Alexandrium pacificum under high light intensity via increased photosynthesis

发表单位：中国海洋大学

发表日期：2023年6月10日

发表期刊：Science of The Total Environment

影响因子：10.753

爱基提供技术：ChIP-seq技术服务

摘要：太平洋亚历山大藻是造成有害藻华的主要物种之一，对沿海生态系统、经济和公共卫生构成严重威胁。光照强度是影响红潮发生的重要非生物因素，在一定范围内，增加光强可以促进太平洋亚历山大藻的快速生长。该研究旨在阐明H3K79甲基化（H3K79me）在太平洋亚历山大藻快速生长和有毒红潮形成过程中对高光照强度的响应的分子机制。研究发现与对照相比，在高光下H3K79me的丰度增加了2.1倍，这与HL下快速生长趋势一致，它们俩都可以被EPZ5676抑制。研究首次利用太平洋亚历山大藻的转录组数据构建虚拟基因组，并利用ChIP-seq鉴定了高光强下H3K79me的效应基因。研究结果显示差异修饰的相关基因主要富集在“能量代谢”、“碳代谢作用”和“氨基酸代谢”。这些发现再通过ChIP-qPCR证实。随后，通过对ChIP-seq和差异表达基因的联合分析，鉴定出H3K79me相关基因CP43和GOGAT。

最后，使用H3K79me抑制剂EPZ5676进行药理实验表明光合作用相关基因CP43的表达显著降低了2.5倍，太平洋亚历山大藻在高强光下最大的光化学量子效率降低了1.2-1.8倍，抑制太平洋亚历山大藻的生长。这些结果表明H3K79在调控太平洋亚历山大藻的快速生长中发挥作用，并且光合作用可能是一个重要的调节途径，这是首次从H3K79me的角度提供了有毒红潮形成的表观遗传学证据。