组蛋白修饰攻略：功能与分布位点汇总

组蛋白修饰常见的功能包括：转录激活和抑制、细胞分化、细胞有丝分裂、DNA损失修复，但最为普遍的功能是对基因表达的调控（转录激活和抑制）。它通过改变染色质的结构，影响DNA的可及性和基因的转录活性。

组蛋白修饰通过在组蛋白的特定氨基酸残基上添加或移除化学基团，影响染色质结构和功能，从而调控基因表达。组蛋白修饰主要包括甲基化、乙酰化、乳酸化、泛素化、磷酸化等。其功能会因其修饰氨基酸类型、修饰位点、修饰类型以及修饰程度而不同。以研究较多的组蛋白H3K4为例，该位置上的甲基化程度不同，它们在基因组上的分布有所不同。

图：H3K4甲基化标记及其基因组分布^[1]

H3K4me1、H3K4me2 和 H3K4me3 分布在基因组的不同区域。H3K4me3、H3K4me2 和 H3K4me1 在活跃转录基因的TSS周围呈逐渐扩散的分布。此外，H3K4me1 在远端增强子区域分布，通常充当增强子标记。

在研究组蛋白修饰时，四种标准组蛋白中的每一种都可能在多个位点被修饰，其N末端具有不同的修饰。但在实际研究中，研究人员倾向于研究组蛋白H3上的一些修饰。它们在基因调控中具有很好的特征。

图：组蛋白修饰在T细胞中活性基因和沉默基因的转录调控元件中的分布^[2]。

我们汇总了常见的一些组蛋白修饰的功能和位点供大家参考（后续会持续更新）。比如常见H3K4me3、H3K27ac都是重要的表观遗传学标记，不少文章选择它们的ChIP-seq或CUT&Tag表观数据作比较。

常见组蛋白修饰功能及分布位点（持续更新 ing)

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• 参考文献

• Collins, B.E., Greer, C.B., Coleman, B.C. et al. Histone H3 lysine K4 methylation and its role in learning and memory. Epigenetics & Chromatin 12, 7 (2019).

• Lim, P.S., Shannon, M.F., H, K. Epigenetic control of inducible gene expression in the immune system. Epigenomics. 2(6):775-95 (2010).

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