用Excel画差异代谢物和差异表达基因的共富集图

◆   第一步：准备转录组和代谢组的KEGG富集结果。将它们放在同一张表格中，提前将富集的Pvalue值转换为-log10(Pvalue)，参考下图：

◆   第二步：画图

2.1 选中数据-插入-图表-二维柱形图-簇状柱形图，就出现两列的图形。

2.2 删掉图表标题，去掉方格线，暂时去掉图例，将图的高度和宽度拉大。

2.3 添加横纵坐标轴。选中坐标，从右侧的设置坐标轴格式-坐标轴选项-刻度线-主刻度线类型(J)-外部。另外将填充与线条-线条-颜色（设置为黑色）-宽度-1.25磅。

2.4 添加纵坐标标题。选中纵坐标，从上方设计-添加图表元素-坐标轴标题-主要纵坐标轴。

2.5 修改横坐标文本的方向。选中横坐标，设置坐标轴格式-文本选项-文本框-自定义角度（-45°）

2.6 调整横纵坐标文本及纵坐标标题的字体和大小，按照投稿需求和图形美观设置即好。

2.7 添加绘图区的边框。将光标放在绘图区上，双击鼠标左键，从绘图区选项-边框-线条（黑色）-宽度-1.25磅（和坐标轴的宽度一致）。

2.8 添加数据标签。单击鼠标左键选中代表数据的柱子，单击鼠标右键，选中添加数据标签。将原始数据的单元格设置为保留小数点后2位或3位。

2.9 设置标签文本。选中标签，从右侧的设置数据标签格式-文本选项-文本框-文字方向-所有文字旋转270°。同样修改标签文本的字体和字号，和坐标轴文本及坐标轴标题保持一致。

2.10 图柱改色。单击鼠标左键选择代表数据的柱子，从右侧设置数据系列格式-系列选项-填充与线条-填充-颜色（换成自己喜欢的颜色就行）。

◆   第三步：PPT完善细节

3.1 添加显著线条。将Excel画的图复制到一个新的PPT里，从上方导航栏选插入-形状-直线，分别从纵坐标2、约1.3处和横坐标的交点处画线到图区的最右侧。可以调出纵坐标的次要刻度线，设置最小值为0.1，辅助画线。

3.2 设置显著性线条。单击鼠标左键选择线条，从右侧设置形状格式-填充与线条-线条-颜色-宽度-短划线类型-线段类型依次设置。

3.3 添加图例。分别插入矩形形状和直线形状，矩形形状的填充色和轮廓色都可以用取色器从图表上对应的柱子取。

3.4 添加图例对应的文本框。要记住每个都是对应的什么，比如我这张图里，粉色柱子代表基因，蓝色柱子代表代谢物，绿色虚线代表Pvalue=0.01，紫色虚线代表Pvalue=0.05。

3.5 导出结果。将整个文件以PDF文件输出，这样是矢量图，再用PDF编辑器导出图片格式即可。

◆   第四步：双柱状图的变形

4.1 我们也可以将横着的双柱状图画成上下的，只需要将其中一组数据改为次纵坐标就行。以2.10做完的图为例，单击鼠标左键选择柱子，然后单击鼠标右键，选择更改系列图表类型，将代表meta的这些数据勾选为次坐标轴。

4.2 设置纵坐标。按照2.3的步骤，设置主、次纵坐标的最大、最小值（设置为最大值的负数）。次坐标轴设置的时候勾选逆序刻度值，主坐标的数字格式都改为正数，设置为自定义-0;0;0。横坐标标签位置设置为低，删掉次纵坐标的数字。

4.3 此外，标签文本也可以设置边框线条。选中标签，按照设置数据标签格式-标签选项-边框-实线-颜色。

4.4 PPT补充细节，导出矢量图。

◆   写在最后：

Excel虽然日常且简单，但也包含诸多功能，一些基础的柱状图和折线图等都是可以完成的，分享此文和大家共勉学习。

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